药物流产失败或不全，首先会出现未见明显孕囊排出来，出现出血量增多，大出血，失血性休克，感染，严重感染导致败血症等，如果药流不全需要行清宫手术，远期并发症有盆腔炎，子宫内膜炎，继发不孕等，建议尽早做彩超来判断药物流产的效果，判断宫腔内有没有残留物的情况。
药流失败一般要进行人工流产。
药物流产是一种常见的流产方式，一般是在米索前列醇注射后6个钟头内，没有出现明显的腹部疼痛和阴道流血，也没有将子宫内的卵泡取出，因为药物流产的原因，可以选择人工流产。在药物流产的那天，没有进食，可以做无痛人工流产。如果还不想继续进行人工流产的话，可以在后部的后部塞三颗米索前列醇，观察能否引起子宫收缩，从而将孕囊取出。
一般情况下，药流失败可以考虑采取人工流产的办法，具体内容如下：
药物流产是一种通过服用药物从子宫中取出的方式来结束怀孕。服用药物后2-4个小时可以排出。药物流产不成功，需要先进行B超，确定怀孕的部位。如果孕囊的部位没有变化，说明是对药物的不敏感，可以进行人流手术。孕囊卡顿发生于宫腔下方或宫颈部时，可用前钳夹取。这个术式较为容易完成，病人也不需要太过担心。
不论什么时候要做药流，首先必须确定是否宫内妊娠，确定宫内孕后，要进一步确定孕周来考虑是否能够做药流，药流必须在医生指导下处理。目前对坐月子有很多反对意见，也可以结合自身情况考虑。哺乳期建议采取有效避孕措施。
一般来说，药流失败生下孩子畸形率不高。
孕妇使用米非司酮、米索前列醇进行药物流产，但是都没有什么效果，没有流血，没有腹部疼痛，甚至连孕囊都没有脱落，那就说明药物流产失败。而药流不成功，胎儿畸形的几率很低，因为药物流产失败往往就是药物对胎儿的作用不大，导致胎儿无法从子宫中取出。但是因为药物流产的药，会对胎儿造成一定的伤害，所以医生会建议放弃这个孩子。
通常在服药后如果有效，会较快出现腹痛和阴道流血，并排出子宫内的怀孕组织，这种药物必须在医院服用。服药后留院观察4到6小时，大部分人可在这段时间内排出绒毛，有的要在服药24到72小时才能排出。如果观察超过72小时仍无绒毛排出，则考虑药流失败，需要行清宫术。
