保守治疗，服用一些活血通络、除湿、抗毒类的药物来进行缓解这种症状；肾造瘘术，若肾积水病因不去除时，应在梗阻以上先行引流，待感染控制后，梗阻原因不能解除时，肾造瘘则作为治疗措施。
肾积水根本原因就是梗阻导致的，要排除肾积水，最快捷的方法就是解除梗阻，比如，如果是结石导致的，尽快碎石、清石，如果是输尿管肾盂连接部狭窄导致的，尽快解除狭窄，手术治疗，如果是炎症导致的，尽快抗炎治疗等。
肾积水较轻，病情进展缓慢，肾功能已达平衡和稳定状态可观察，但应定期检查了解积水进展情况。可自行解除的梗阻，如孕妇生理性肾积水。肾积水进行性加重，临床症状明显，肾功能不断下降，梗阻病因明确，有并发症存在，应手术治疗。
药物治疗，合并感染者应给予抗生素治疗，消灭感染，缓解症状；冲击波体外碎石治疗，该技术是根据结石大小，电脑自动跟踪，精确定位结石，通过超声波的冲击，在体外将结石击成粉末或小米粒状，然后随尿液排出体外。
经皮肾镜取石术，是通过经皮肾穿刺造瘘所创建的通道，经X线荧光透视监控，在内腔肾镜直视下借助碎石和取石器械达到去除结石，解除梗阻的一种技术和治疗手段。开放手术取石术，目前开放手术只适合很少一部分病人，如无功能结石性脓肾、结石合并癌症，或微创技术治疗无效者。
如果肾积水合并严重感染，导致感染性休克，需及时抢救，感染性休克病死率高达50%。肾积水严重程度不同，对患者的寿命影响也不同，中重度肾积水，可能导致肾脏感染、肾脏积脓、肾功能减退，病情发展可导致肾功能不全，引发尿毒症等严重疾病，威胁患者生命单纯肾积水，对患者的寿命影响不大。
