可以通过激光，手术切除等方法治疗。也可以去医院皮肤科求治，给予正规治疗。患者需要保持局部皮肤清洁，防止局部外伤，不要频繁的触摸或摩擦局部，保持心情舒畅，避免情绪波动，多喝开水等。
可以采用激光治疗的方法。激光去除色素痣做法是首先用药物擦洗治疗部位，消毒，然后用激光作用于病变皮肤，传输的能量会在瞬间使组织里的水分气化，同时带走有色素的皮肤组织，而不伤及周围健康组织。但是如果面积较大的色素痣，而且颜色比较深，就需要采用植皮的治疗方法。
色素痣大多数和父母遗传基因、发育异常、色素细胞良性增生等，许多因素都有发现原因，最好到医院皮肤科就诊，根据医生指导，选择有效方式去除。
1、父母遗传基因：色素痣和父母遗传基因有关系，受到父母显性遗传和隐性遗传后会有黑色素痣，但没有影响到外观的情况下，可以先随着时间对于密切观察，如果有些严重和影响，在液氮冷冻方式去除，液氮冷冻会产生低温，然后破坏色素痣的组织，所以有利于色素痣的脱落。
2、发育异常：色素痣和先天性发育异常有关系，也是属于发育缺陷相关的疾病，体内的黑色素会有分泌减少的状况，如果有必要可以选择通过激光方式去除掉。
3、色素细胞良性增生：黑色素细胞出现了良性增生也会形成色素痣，如果色素痣的体积比较大，可以手术切除。
眼角长色素痣一般并不用治疗。
眼角有色素痣，一般是不影响眼睛的正常功能的，提出不需要治疗。色素痣如果影响了眼睛的正常功能，可以考虑是由于黑色素痣的面积很大，或者是有增大的迹象需要手术治疗，。另外，如果色素痣的体积太大，可以通过移植皮肤，或局部皮瓣来进行相应的处理。这样既能在术后达到更好的效果，又能在眼角术后保持更好的状态。
色素痣通常要做体格检查、组织活检等，具体分析如下：
1、体格检查：需要观察皮肤痣的颜色、范围、大小，以及有没有出血、溃破等情况，还要触诊痣的质地、硬度、活动度等。斑疹、丘疹，直径在6毫米以下，呈不规则的对称分布。另外，体检也能与其它疾病相区别。
2、组织活检：在色素痣切除术后，对组织切片检查，以确定是否存在恶性或有可能发生癌变，这对色素痣的诊断及鉴别诊断具有重要意义。
脸上长色素痣可能是色素沉着、黑色素瘤等原因导致的，不同原因可采取不同的治疗方式。
1.色素沉着：长时间在户外活动的人，由于紫外线长时间照射，可能会由于黑色素沉着在脸上后，进而长色素痣。建议可以通过戴防晒帽、涂抹防晒霜等方式来减少紫外线的照射。
2.黑色素瘤：黑色素瘤是黑色素细胞来源的一种高度恶性的肿瘤，患者如果患上了此病，脸上可能会突发新生的黑褐色斑片或者斑块，患者还可能因为其黑褐色斑片以为长的是色素痣。患者可以在医生的指导下使用注射用达卡巴嗪、替莫唑胺胶囊、紫杉醇注射液等药物进行治疗。
