小儿直肠给药首先会刺激肠蠕动，引起蠕动加强，可以造成小儿腹泻。再就是直肠给药以后使肠蠕动减慢，引起肠梗阻或者是肠套叠，小儿会出现哭闹，食欲不振，呕吐，面色苍白。还有小儿直肠给药，直接通过肠粘膜局部吸收，引起肠粘膜的损伤，造成黏膜出血，小儿出现血便，腹痛，肚子胀，哭闹。所以要根据娃娃状况需要慎重选择是否直肠给药。
小儿直肠给药副作用较小，痛苦小，吸收较快，操作简单，比口服安全，是种很好的给药方法。
口服药要经过肝肠循环，进入血液循环后才能发挥作用，会损伤肝脏。直肠给药吸收快，药力不减，肝脏没有负担。不想口服药物可以通过直肠给药，肠黏膜吸收药物进行治疗，比较安全，除了药物的副作用，很少有不良反应，患者要多喝水，清淡要清淡，有预防幼儿疾病的效果。直肠给药要及时排便，给药后20分钟内不要大小便，适当抬高臀部有助药液吸收。
直肠给药也是有一定弊端的，不同年龄段的孩子身体的结构差异性是比较大的，由于直肠静脉回流的个体差异性会导致药物吸收的程度有一定的差异，可能会导致治疗剂量不足或者说剂量超标而出现中毒反应，同时反复的直肠给药可能造成直肠黏膜的损伤。
小儿直肠给药是否合法，具体分析如下：
在临床上，存在很多局限性和副作用。在手术的时候，要选择可以直接给药的药物，同时要注意手术的技巧。小儿可以通过直肠给予的药物很少，在说明书中会有明确的说明，可以通过灌肠或直肠注射。水合氯醛是儿童抽搐的常见药物，说明书上写着可以口服或者灌肠。还有就是小儿退热使用的退热栓，也标明是直肠给药。
宝发烧直肠给药和打针直肠给药伤害少一些，因为打针本身就是有损伤性治疗，临床治疗疾病的基本原则是可吃药可不吃药不要吃药，可吃药可打针的不要打针，可打屁股针可打静脉针的不要打静脉针。
