孢子菌感染可以口服药物来治疗，然后用药物清洗，如果被感染部位有瘙痒的症状，瘙痒时千万不要剧烈的去抓挠它，以免引发进一步的感染，平时一定不要抽烟，不要喝酒，以免加剧病情的变化。
复方吲哚美辛酊，这种药物主要成分是吲哚美辛，也含有一定的扑尔敏。所以，这种药物的主要作用是消炎、止痒，同时具有抗过敏的作用。由于该药物含有一定的酒精，所以对皮肤具有一定的刺激性。临床上应用大多是慢性的皮肤病，比如神经性皮炎、慢性湿疹或者扁平苔藓，也可以用于慢性头皮脂溢性皮炎等。
糠皮孢子菌毛囊炎，是由糠皮孢子菌引起的毛囊炎症，糠皮孢子菌属于真菌的一种。糠皮孢子菌毛囊炎的诊断主要是和细菌性毛囊炎进行鉴别，细菌性毛囊炎炎症比较明显，对于抗生素治疗有效果，而糠皮孢子菌毛囊炎的炎症较轻，对于一般的抗菌治疗无效。临床上可以取毛囊炎内容物涂片检查，发现孢子即可诊断。
可以短期内适当的使用糖皮质激素，应该适当的卧床休息，维持正常的生命体征，保证稳定正常的水电解质、酸碱平衡。在出现缺氧状态时可以适当的吸氧，保证孩子呼吸道的畅通。
肺孢子菌肺炎治疗首选方法是药物治疗。比较常见的药物可以选择复方磺胺甲恶唑，要选择早发现早治疗的方式，让身体快速的恢复，通过早期的判断能够查看出病情的轻重程度是比较重要的。如果病情持续的发展导致越来越严重，通常是没有太好的特效药物改善。患者出现肺孢子菌肺炎，通常是肺孢子菌导致了间质性细胞炎症，这些情况是很少见的。
糠秕孢子菌毛囊炎是由糠秕马拉色菌引起，该菌是人体皮肤的正常菌群，也不要用过热的水继续烫洗，不要食用辛辣刺激海鲜类食物，从饮食进行改善多吃养颜的蔬菜和水果等，改善质量。
