巧克力囊肿通常很痛。大多数卵巢巧克力囊肿发生在黄体期或月经期。疼痛常常从一侧开始。正常子宫内膜生长在子宫腔，如果这是一个病态的子宫在盆腔的其他部分将增长，导致一系列的分泌和月经的变化，因此聚合成不同大小的结节，如这些结节一旦破裂，囊肿包含旧的血液扩散到腹腔，常常导致不孕症状，及时治疗，正确的治疗在于及时手术治疗。
女性有巧克力囊肿最典型的症状就是痛经。观察一下囊肿的大小来决定治疗方案。如果巧克力囊肿比较大，并且位置并不是很好，那么还是尽早的手术治疗比较好一些。可发生剧烈腹痛、甚至休克，并伴恶心、呕吐。只要确诊，即立即手术切除。
及时去正规的医院做进一步的检查，然后根据检查结果，尽快选择合理的方法手术治疗。如病情发现的比较早，治疗的比较及时，相信病情也是可以缓解的，在治疗过程当中，一定要把心情放松，思想上不要有什么压力。
巧克力囊肿的症状表现，有小腹疼痛，小腹不适，白带增多，白带色黄，白带异味，月经失常，而且通常小腹内有一个坚实而无痛的肿快，有时性交会发生疼痛。当囊肿影响到激素生产时，可能出现诸如阴道不规则出血或毛体增多等症状。较大的囊肿会对膀胱附近造成压迫，引起尿频和排尿困难。
卵巢巧克力囊肿疾病最突出的症状就是痛经，会让病者出现经期腹痛的感觉，而且性交的时候也会有可能出现疼痛感，所以说病者出现疼痛的感觉就应该警惕起来，一般还会伴有不孕的症状出现，月经改变也比较明显。也就来月经和性交的时候会疼痛，不会忽然疼痛。
巧囊破裂后有疼痛的情况有出血，而疼痛的时间长短是和个人体质情况和巧囊的大小，对于痛感的承受能力等众多因素有关。有些巧囊破裂后的疼痛感只有几分钟或者是数小时的感觉，这种疼痛感持续三天时间或更久。
