甲减会影响到生育，而男性则会因为甲减而导致精子的品质下降，而女性则会因为甲减而导致卵子的品质下降，从而导致排卵，导致经期过多，或者出现更年期。
甲减引起的生育问题可以通过治疗来解决，目前甲减的治疗方法是外源性的甲状腺激素，优甲乐是最常见的治疗方法，其目的是保持甲功的正常，甲功恢复后的甲减不会对怀孕造成任何的不良反应，并且可以长期服用优甲乐作为治疗手段。大多数的甲减属于终生性的甲减，必须终生服用药物，不能随便停药，如果停用了，就会慢慢复发。
甲减会影响妇科手术，如果是甲状腺功能减退症患者，甲状腺功能不能控制在正常范围内，贸然手术可能会导致粘液性水肿，甚至危及生命。所以如果要做手术治疗，首先要做甲状腺功能检查，明确甲状腺功能状态，如果患者处于甲状腺功能亢进症或甲状腺功能减退症时期，不能完成手术，需要服用药物，将甲状腺功能控制在正常范围后再进行手术治疗。
当准妈妈患有甲减时，胎儿就会和妈妈来争夺甲状腺激素，一旦胎儿脑发育所需要的甲状腺激素得不到正常供应的话，胎儿脑发育就会出现异常，影响智力和生长发育障碍。而且甲减也会增加胎儿早产、死产及胎盘早剥的危险。即使顺利度过孕期，准妈妈也将面临较高患上产后甲状腺炎的风险。
孕妇甲减可以导致胎儿甲状腺发育缺陷，也可造成胎儿死亡，最主要的是造成胎儿甲状腺激素减少。甲状腺激素是维持机体正常生长发育不可缺少的激素，胎儿的甲状腺功能在妊娠第12周开始建立，妊娠前半期胎儿大脑发育所需要的甲状腺激素完全或主要来自母体，孕妇的甲状腺素特别是对胎儿的脑的发育尤为重要。
甲状腺功能减退高对怀孕的影响。
怀孕期间，欲奴和宝宝共用一个身体，所有的营养都来自于预付，宝宝需要的甲状腺素也完全来自于孕妇，虽然后来开始合成甲状腺素，但是还是要依靠母体内的激素水平。孕妇甲状腺功能异常时，甲状腺素分泌不足，会影响胎儿的神经系统发育、骨骼发育、智力发育等，严重甲减及症状未得到控制，可导致孕妇流产、妊娠高血压、早产率、围生儿死亡率等都会出现明显的升高，因此甲状腺功能减退对母体和胎儿的发育都有很大的影响。
母亲甲减会导致宝宝智力下降，增加孩子出生缺陷几率。母亲甲减会增加婴儿患病的风险，其大多数是智力和发育上的问题，患有甲状腺疾病的母亲生下的婴儿发生出生缺陷的比例约为18%。而在普通人群中，有出生缺陷的婴儿仅约为3%。因此，对于患“甲减”等甲状腺疾病的女性，其胎儿在早期做好心脏缺陷等出生缺陷方面的检查。建议在孕期做好产检，如果筛查到甲减及时治疗，饮食以多维生素、高蛋白、高热量为主，可以降低影响。
