臭豆腐在发酵过程中极易被微生物污染，同时含有大量挥发性盐基氮及硫化氢等，这些都是蛋白质分解的腐败物质，臭味物质可能是蛋白质的腐败而成，所以说有致癌性是可能的。多食对人体有害。
臭豆腐吃多有危害的。臭豆腐中含有丰富的蛋白质，如果食用过多，会使蛋白质在腹部积聚，引起消化不良，出现腹胀、腹泻现象。臭豆腐中含有一定量的皂角苷，可以促进人体对碘的排泄，容易引发碘缺失。
孕妇可以适当的食用臭豆腐，但是不能长期大量食用，否则会对孕妇和胎儿的健康产生不良的影响。
臭豆腐是一种油炸食物，在烹饪的时候可能会不卫生，孕妇食用后会导致肠胃炎、腹痛、腹泻等症状，甚至还会影响到胎儿的发育。
此外，在烹饪的时候，还会产生大量的有害物质，其中还会加入各种添加剂和调味料，这些都会对孕妇的身体和胎儿的发育造成不良的影响。
王致和臭豆腐闻起来臭，但吃起来香，有些人将吃它当成了一种嗜好。臭豆腐多吃不宜。还是具有很大的危害性的。臭豆腐属于发酵豆制品，制作过程中不仅会产生一定的腐败物质，还容易受到细菌污染，其在发酵过程中会产生甲胺、腐胺、色胺等胺类物质以及硫化氢，胺类物质存放时间长了，还可能与亚硝酸盐作用，生成强致癌物亚硝胺。
减肥期间是不可以吃臭豆腐的，豆腐含有的蛋白质多，脂肪比较低，还有能改善易胖体质的成分，简单吃些豆腐可以加强体质，也有饱腹感，这样对减肥有帮助，但是臭豆腐是不能吃的，臭豆腐是油炸的食物，属于经过加工后的食物，组成成分也发生了改变，多是经过高温油炸后制成，热量是很多的，吃了不仅不能减肥，还可能会导致肥胖，所以减肥期间不要吃臭豆腐。