进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
早期肛瘘通过直肠肛门指检，可以摸到条索状的一个管道、大部分通过目测和直肠肛门指诊即可检查出来，少部分复杂或难以确诊的，做腔内超声或者是肛周超声或核磁共振进行确诊，通过直肠腔内超声，能够发现直肠肛围的脓肿、管道等。
粪便脓液-粪便脓液检查，检查方法简单，结果直观，肛门指检-肛肠疾病是临床常见的疾患。其中以痔疮、肛周脓肿、肛瘘、直肠良、恶性肿瘤居多。绝大多数的肛肠疾病可通过肛门指检作出初步诊断，而肛门指检又是极为方便的措施。
肛门镜检查不能完全看到全部直肠的情况，因为直肠的长度大概12到15厘米，肛门镜也只能看到直肠的下段，如果想看到整个直肠的情况，可以做直肠镜或者乙状结肠镜检查，不过现在这些检查都比较少了，都用电子结肠镜检查来代替了，电子结肠镜可以看到整个大肠的情况。
小儿呕吐症状考虑急性胃炎，肠炎，肠梗阻，脑炎等，但脑炎通常伴有发热和头痛等症状，精神差，喷雾呕吐。可以检查血常规，大便常规等可以做脑电图，可能是急性胃炎，急性胃炎一般是由于饮食不当或感冒后引起的。
