糖皮质激素的副作用有如果使用的剂量太大、使用的时间太长，就会造成身体水肿、无力、多毛、以及还会引发糖尿病和高血压等。糖皮质激素会引发或者是加重感染，这种药物能够降低身体的抗感染能力，让细菌更容易繁殖、生长和扩散。
糖皮质激素失眠可以用中药进行调理。
糖皮质激素使用较多的西药种类，其副作用也比较常见。其中常见的副作用之一是失眠、烦躁和情绪激动。遇到这种情况，可以用黄疸、肉桂分别打开10克水泡服，服用后这些副作用基本上可以消失。因此，对这种激素敏感的患者每次用药都会先服用这一方，晚上不会失眠。对于长期服用激素引起的失眠，用15克黄疸、12克肉桂水煎煮，效果良好。
糖皮质激素乳膏有皮炎平软膏、氟轻松软膏、复方倍氯米松樟脑软膏、丙酸氯倍他索软膏、丁酸氢化可的松软膏、糠酸莫米松软膏等。这些软膏是皮肤科常用的外用药，有抗过敏、消炎、止痒、减轻皮疹等功效。
糖皮质激素不能长期使用。长期使用糖皮质激素会出现胃肠道反应，容易引起胃部疾病，消化性溃疡等病症的发生。可能会引起痤疮，多毛，骨质疏松，酒糟鼻，毛细血管扩张等。
支气管扩张不用糖皮质激素，可能是因为糖皮质激素会导致抵抗力下降和炎症扩散，在治疗支气管扩张时，不是只吃一两天要而已，如果患者长时间使用糖皮质激素治疗支气管扩张，可能会出现激素脸，对于支气管扩张不能简单的使用，更不能大量的使用糖皮质激素，可能会出现免疫力下降，后果比较严重。因此在发生支气管扩张时，以抗生素为主要治疗。
吸入性糖皮质激素是目前治疗哮喘的主要手段，对比口服的激素，吸入性糖皮质激素药物可直达肺部，起效迅速，剂量较小，副作用也较小，安全性相对较高。其主要的不良反应有咽部不适、声音嘶哑，并且可能会出现念珠菌感染，但可通过清水漱口加以避免。长期高剂量的使用吸入性糖皮质激素还会产生肾上腺皮质轴抑制和骨质疏松等全身不良反应。
