巧克力囊肿的早期症状有：痛经，痛经是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易忽略的先兆，常进行性加重。性交疼痛，这也是一个明显的信号，可能还伴有点状出血，巧克力囊肿的症状并不是十分的明显。不孕及月经失调。
手术一般有两种方式，开腹和腹腔镜。传统的开腹手术费用较低，3000元-5000元左右，但是创伤大，需要的恢复时间较长；腹腔镜手术创伤小，术后恢复快，费用总计约7000元-9000元左右，但是术后容易引起粘连。
巧克力囊肿手术费用大约5千元-7千元。巧克力卵巢囊肿治疗方法主要采用药物和手术治疗。药物治疗包括假孕疗法，假绝经疗法等，但只能缓解症状控制发展，所以对卵巢巧克力囊肿多主张手术治疗。
卵巢巧克力囊肿早期症状表现有性变疼痛：这也是一个明显的信号，可能还伴有点状流血。不正常的经痛：痛经是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易忽略的先兆。没有采取避孕措施也不会怀孕。
像这种症状。巧克力囊肿一般分为两种类型，即腹腔巧克力囊肿和卵巢巧克力囊肿，通常以卵巢巧克力囊肿病人居多。对于巧克力囊肿女性病人来说，如果想要尽早的痊愈，就需要选择手术的方法进行治疗。而由于巧克力囊肿病人的病情状况不同，所以其对应的手术危险性也就不同。
另外从发病机理到临床表现都可以观察到本病症属于比较复杂的症状，对于女性朋友常说的巧克力囊肿7cm大小一定要引起适当重视，饮食尽量不要吃辣椒海鲜等刺激性食物，以此告诫广大女性要对饮食方面对注意。
