主要是采用对症支持治疗和手术治疗，治疗主要是减轻或缓解病人的症状。可以去神经外科开颅手术将囊肿切除，但是手术风险高，死亡率也很高。脑内囊肿一般可能跟病人压力过大，脑内血管畸形，供血不足等因素有关。
宫颈囊肿属于慢性宫颈炎的一种。是由于长期慢性炎症刺激引起的宫颈腺管堵塞。建议如果现在宫颈囊肿比较小的话，可以暂时观察。如果宫颈囊肿比较大的话，就需要做宫颈囊肿剔除术。术后注意外阴卫生，一个月内禁止同房。
不管中药还是西药肾囊肿靠药物是无法治疗的，由于单纯性肾囊肿多无症状，对肾功能和周围组织影响不大，因此不需治疗，只要6个月到1年随诊。如果囊肿直径较大，超过5cm或产生周围组织压迫症状，引起尿路梗阻，则需要行囊液抽吸术并囊内注射硬化剂。如果囊肿巨大，直径超过10cm则可能需要手术治疗。
肝脏囊肿多是采用手术进行治疗，但是不同症状选择的手术也是不同的。这样才能准确穿刺到经皮囊肿囊液，操作相对比较简单，但是一定要严格采取无菌技术，避免囊内出现血和脓肿，所以要选择正规医院进行治疗。肝脏囊肿还可以采用囊肿摘除术，多用于容易剥离的单发性囊肿患者，治疗会更彻底。
在中医理论中有肝肾同源之说，那么针对肾囊肿有作用的中药治疗方式也可以用到肝囊肿的治疗中来，因为肝囊肿或肾囊肿的治疗上不能只求活血通络带动囊内液体的传送，还要抑制囊壁上皮细胞继续分泌液体。这样才能起到好的治疗效果。
口服药物没有效果，不要盲目服用药物。出现囊肿一般需要采取手术治疗，可以到正规医院外科就诊检查治疗。手术后要注意休息，注意卫生，按时换药，可以根据伤口情况采取消炎药等药物治疗，具体治疗可以遵医嘱进行。
