肥厚性疾病的处理相对困难，以不一定能根治为主。
肥厚性心肌病以改善症状为主，降低并发症，防止猝死的发生，其中，药物治疗为肥厚性心脏病治疗提供了依据，以流出道梗阻为治疗目标的药物包括β受体拮抗剂，非二氢吡啶类钙通道阻滞剂等。当存在心衰时需针对心衰进行药物治疗，在伴有房颤的情况下，需给予抗凝治疗。对胸闷不舒服患者，应用硝酸酯类时，应引起重视，要排除外流道梗阻，以免用了以后加重病人的病症。非药物治疗以手术为主，酒精室间隔消融术为辅，及起搏治疗，对现在的病人普遍建议酒精室间隔消融，但还需结合适应症而定。
肥厚性心肌病需根据具体病症进行治疗。
肥厚型心肌病一时之梗阻性肥厚型心肌疾病，针对该病的治疗，可以选择药物保守治疗，常用的药物有纠正心衰的药物、逆转心室重构的药物，例如β受体阻滞剂等。梗阻型肥厚性心肌疾病比较危险。因为梗阻往往会出现低血压、恶性心律失常、心绞痛等症状。如果心排血量受阻，会导致机体供血不足，脑供血不足，冠状动脉供血不足，这是非常危险的。一般都会选择无水酒精消融，这样可以减轻梗阻，从根本上治疗。
治疗肥厚性心肌病的药物可以找针对流出道梗阻的药物进行治疗，药物治疗是治疗肥厚性心肌病的基础治疗方式。肥厚性心肌病是遗传性心肌病的一种类型，以心肌肥厚为主要诊断依据。肥厚性心肌病病人会出现呼吸困难，胸痛，心律失常，晕厥等。
心肌结构和心功能的检测是肥厚性心肌病的首选。
心肌的结构是通过做心彩色超声和彩色超声来检测，可以看出不均匀的室壁肥厚，也可以检测到心脏的扩大。而心脏的检查，主要是通过心脏B超来进行，因为心肌的弹性会降低，导致心肌的舒张能力降低。当出现了输入管，即为肥大阻塞性心肌病，在出现心源性射血时，排出道的血流量会变慢。
肥厚性心肌病的症状有绞痛、胸痛等，需要及时进行治疗。
肥厚性心肌病主要以心肌肥厚为特点，患者常伴有心绞痛、胸痛、晕厥、心悸、头晕、劳力性或阵发性夜间呼吸困难等症状。患者需要在医生的指导下通过二尖瓣置换术、肥厚肌肉切除术等方式进行治疗，帮助缓解相关症状。
日常生活中，患者应当规律作息，不要长时间熬夜。
对于没有明显的临床表现，没有明显的临床表现是可以不必进行治疗的，这是由于病人的生命中没有明显的表现。若病人有临床表现，并有可能是因此病所致，可以服用美托洛尔，服用美托洛尔片；若病人的病情没有好转，可以转而使用维拉帕米。同时伴有心脏功能不全的病人也可以使用呋塞米片利尿；同时出现心律不齐的情况下，可以口服氨碘酮来提高心率。
