肾结石的疼痛部位常位于脊肋角、腰部和腹部，多数呈阵发性，也可为持续性疼痛，肾绞痛常见于结石活动并引起输尿管梗阻，输尿管绞痛的特点是一侧腰痛，剧烈难忍，可放射到下腹部、睾丸或阴唇。
通常情况下，肾结石更容易引起患者的疼痛，尤其是腰腿疼痛。
肾结石有疼痛一般情况下都属于正常现象。患者有疼痛，应该及时去医院检查，同时也应该接受正规治疗。肾结石发病初期，若是形成急性梗阻的话，那么就会引起腰部疼痛较为剧烈，要及时去医院做详细检查，以明确结石具体病情，之后再对症治疗一些。如解除输尿管痉挛止痛药物等对症处理，此痛可有减轻。与此同时，对于肾结石也要积极的治疗，只有把肾结石完全的排干净了，这样的痛苦才能得到完全的治愈。
可对症止痛处理，口服药物一般效果都较差，通常需注射一些效果较好的激动剂，结石是一个与机体有较大关系的疾病，所以平时也需多喝水、多运动，预防结石的发生。多饮水，则泌尿系尿液形成多，尿液冲洗，所以泌尿系这方面就相对会好一些。
肾结石疼痛在医学上被分为是11级疼痛，是内脏疼痛。医学上最严重的疼痛分级是12级，就是母亲的分娩痛。内脏疼痛仅次于分娩痛。肾结石的疼痛一般都是因为结石排泄过程中导致输尿管痉挛，肾脏积水，疼痛呈阵发性绞痛，疼痛向下腹部膀胱区及后腰部放散，同时有血尿，还伴有恶心呕吐胃内容物。患者因疼痛辗转反侧，痛不欲生。
结石在肾盂肾盏中，这时产生疼痛的部位就是在肾脏中。结石的部位在输尿管中，如果卡压在输尿管的情况下，就会引起腰部中段的疼痛。结石在膀胱内，一般是不会引起疼痛的状况。
