自然流产第三天了腰疼可能是多种原因导致的，具体分析如下：
如果女性在自然流产后三天会感到腰痛，可能是由于受了某种寒气的刺激，也可能是由于没有休息好，也可能是由于工作过度导致的。在流产后要多休息，不要过度劳累，不要做太多的体力活，要让自己的情绪得到充分的释放。同时要注意保持外阴的卫生，经常更换卫生巾，在一个月之内不能同房。需要到医院做个全面的检查，确定是什么导致了自然流产，然后才能对症治疗。
自然流产以后出现宫缩痛是属于正常的，女性在自然流产或者是在正常的生产以后都会出现不同程度的腹痛，一般疼痛都不太严重，也能够忍受，而且随着时间的推移疼痛会逐渐的减轻直到消失。如果是宫缩痛比较严重可以在医生的指导下服用止痛的药物，另外也可以通过按摩小腹对腹部进行热敷来缓解腹痛症状。
肛门处有坠胀感是有痔疮的可能性，可以到正规医院挂肛肠科就诊，检查一下明确诊断后对症治疗。平时要多吃新鲜的水果蔬菜，不吃油炸辛辣刺激性食物，保障肛门及周围皮肤清洁干燥，如果症状严重时可考虑手术治疗。
怀孕以后出现的自然流产一般属于胚胎发育不好的情况，是人类进化自然过程适者生存的表现。自然流产后，阴道出血的时间一般不会超过10天，但是流血量会比正常来一次月经量要多。如果B超检查宫内干净，可不必处理。等下一次来月经之后，可以选择同房。但是同房期间需要采取避孕措施。自然流产以后，不要在第二个月就怀孕，最好是自然流产半年以后才准备怀疑，对女性身体都比较好。
自然流产一般10天就可以流干净，通常自然流产有一个过程，开始的时候是子宫收缩，然后出血，胚胎渐渐脱离子宫内膜后排出。胚胎排出去以后并不能说明自然流产干净，因为还有很多蜕膜，这些蜕膜也需要慢慢排出，一般在2周之内蜕膜慢慢会清理干净。
月经第七天还有褐色分泌物，如果没有其他伴随症状，暂时不考虑为病理性的，为正常情况。正常月经经期时长为3到7天，由于个体的差异，有些人可能会持续7天，如果一周后还是有少量褐色分泌物，要考虑为内分泌的失调，子宫内膜不协调的脱落，或者属于妇科上的炎性刺激所引起的少量出血，这是不正常的，患者应该及时去妇科门诊进行进行综合评估，明确具体的原因。
