巧克力囊肿是一种子宫内膜异位症的表现形式，目前认为以腹腔镜确诊、手术加上药物为内异症治疗的金标准。有条件的医院，腹腔镜手术应为内异症的首选治疗方法。但腹腔镜手术的选择及效果在很大程度取决于设备、器械和手术者的经验及技巧。开腹手术可用于腹腔镜条件不具备或非常复杂的手术，如严重粘连和有多次手术史者。治疗时需要去正规大医院。
卵巢囊肿忌食刺激性食物及饮料。禁食热性、凝血性和含激素成分的食品。饮食宜清淡，饮食应富含足够的营养，纠正偏食及不正常的饮食习惯，不食发物。多补充蛋白质，蛋白质是抗体的重要组成成分，如果摄进不足，则会造成人体的抵抗力下降。手术后半个月内，更应该注意蛋白质的摄入。
要荤素搭配，饮食多样化。多吃新鲜的蔬菜和水果忌辛辣刺激性的食物。定期复查，做到有情况早发现。不使用蜂蜜及花粉等。平时加强体育锻炼，生活有规律。避免高度紧张及精神刺激，保持乐观情绪及充足睡眠。
药物治疗效果不明显，或卵巢有较大包块的，可以采用保守性手术，如卵巢内膜囊肿巧克力液抽吸术，内膜囊肿剥除术或患侧卵巢切除术，以保留正常卵巢和生育功能。不过，经保守性手术后仍有可能复发，适宜食物：牛奶、菠菜、白菜、油菜、香菇、瘦肉、鸡蛋、鲫鱼、苹果、鸭梨、大枣、花生、黑米等。
饮食上多增加营养，经期不吃凉食物。巧克力囊肿是子宫内膜异位引起的。属于良性病变，可以遵医嘱口服止痛药物治疗。腹部要保暖，定期去医院复查，经期不要过性生活。如果还不好，可以去正规医院手术治疗。
巧克力囊肿是一种妇科类的疾病，患有巧克力囊肿会有痛经，月经不调，性生活痛。巧克力囊肿可以多吃新鲜的水果和蔬菜，不宜吃辛辣刺激性食物，清淡为主。合理的膳食搭配不仅有素，还有荤菜。肉类食物能够补充人体必需的氨基酸，蛋白质，脂肪等。
