通过牙周洁治，能够去除龈上牙石和部分龈下结石，再用手动刮治的方法，去除龈下剩余少量结石，牙结石即可清除干净。全口洁治后牙齿较敏感，1-2周内不能吃过热过凉食物，以免受到冷热刺激。
膀胱结石的最佳治疗方法大体上两类，一类为手术取石，一类为非手术碎石，其中手术取石即传统的耻骨上膀胱切开取石术，另一类的非手术碎石则又可分为膀胱镜机械碎石大力钳碎石、液电效应碎石、超声碎石、弹道气压碎石等。
对于输尿管结石的治疗原则是小于5毫米的不需要特殊治疗，可以自己排出；大于5毫米小于2厘米的可以做体外碎石治疗。大于2厘米的需要手术治疗。患者可以根据超声显示的结石大小进行治疗。同时多喝水，应用消炎药预防感染。
如果是肾脏内比较小的结石，也可以出现轻微的腰困，腰酸等。如果肾结石比较大，就会出现腰部明显的憋胀不适，尿血等。如果肾结石掉入输尿管狭窄处，还可以出现腹部剧烈的绞痛，恶心，尿频等症状。
肾结石临床较为常见，肾结石是否需要采取治疗，应结合具体患者情况具体分析，以肾结石具体情况为主。
有的肾结石可能位于肾盏中，未形成梗阻，尤其肾脏下盏时，这也许是不重要的，没有问题。当然，也有一些肾结石，一旦梗阻形成，就必须进行处理，应及时给予处理，适时排出结石，才能防止不良后果的发生。部分患者如能及时发现，也许保守治疗会更有效，部分患者若发现较晚，那么就需要手术了。
