支原体肺炎可以通过药物治疗、生活护理等方式进行改善。
及时给予合适的抗菌素可以缓解病情，减少病情。支原体肺炎有一定的自限性，大部分情况下都能自行治愈。病情较重的患者可以选择红霉素、链霉素、阿奇霉素等大环内酯类的抗生素。对于大环内酯类的药物，如莫西沙星、左氧氟沙星等，一般都是比较不灵敏或者无效的。
支原体咳嗽可以通过药物治疗来改善。
如果是支原体感染，可以考虑使用大环内酯类的药物。症状轻微的患者可以服用口服的药物，严重的需要进行静脉注射。阿奇霉素、红霉素、罗红霉素等是临床上比较常见的药物，一般需要两个星期以上的疗程，这样才能防止复发。如果出现对大环内酯类的药物，可以选用氟喹诺酮类的药物，比如莫西沙星、左氧氟沙星等。如果出现剧烈的咳嗽或者有明显的咳痰症状，需要针对具体的症状进行合理的治疗。咳嗽药要低剂量使用，痰中有太多粘性的病人要服用氨溴索或氨溴特罗等化痰消炎药。
妇科支原体的治疗通常无效果最好的药，通常使用较多的是抗生素。
妇科支原体感染在临床较为普遍，主要原因是个人卫生没有重视，致使在此期间诱发尿频、尿痛和外阴瘙痒、分泌增加等表现。由于支原体无细胞壁，治疗方面多采用四环素或者林可霉素类抗生素药物进行治疗，例如氟罗沙星、盐酸多西环素片剂和林可霉素。
具体使用药物患者需及时去医院向医师咨询，视具体情况而定，切勿私用。
当男性感染支原体后，因支原体无细胞壁，故头孢类抗生素、青霉素类抗生素治疗支原体效果不佳，需要采取其他抗生素治疗。
男性感染支原体后，可遵医嘱选用喹诺酮类抗生素，例如盐酸左氧氟沙星片等、盐酸莫西沙星；或应用大环内酯类抗生素，例如阿奇霉素片、红霉素肠溶胶囊，或用四环素类抗生素治疗，例如盐酸多西环素片、盐酸米诺环素胶囊及其他。
解脲支原体用药应根据具体的情况来选择。
解脲支原体是人体排泄生殖道的寄生虫，如果身体抵抗力降低，就会导致阴道、宫颈等生殖器感染，与流产、不育、胎儿宫内发育有关。
对于解脲支原体，可以口服左氧氟沙星片、阿奇霉素片、美满霉素胶囊等药物；还可以服用三金片、热淋清胶囊等清热利湿的中成药。
男人支原体吃大环内酯类药最有效。
如果是支原体感染，可以进行分泌物的培养和尿培养，来确定支原体的药物敏感性，然后进行针对性的用药，通常可以服用阿奇霉素片、多西环素胶囊等大环内酯类药。经过2-3个星期的时间，基本上可以将支原体彻底清除。
另外，还可以服用一些清热利湿的中成药。