是由于先天性甲状腺发育不良或甲状腺激素合成过程中酶的缺陷所造成的。表现如便秘、黄疸消退延迟、少动、少哭、生长发育迟缓，皮肤比较粗糙、干燥，智力低下表现，与之互动时无眼神交流，无主动沟通意识。
甲状腺功能低下是由各种原因可导致的肌体的甲状腺分泌过少而产生的各种症状，简单的说可以有原发性和继发性两个部分。除了自身免疫性甲状腺功能低下还会有各种诱因导致的甲状腺功能低下，比如大量碘的摄入。比如常用的胺碘酮导致的甲状腺功能低下，或者垂体瘤、下丘脑肿瘤导致的甲状腺功能低下。对于有明显诱因导致的甲状腺功能低下，要首先去除诱因，服用外源性的甲状腺激素。
新生儿先天性甲状腺功能低下的症状有：智力低下、表情迟钝、异常安静、不活泼、矮小、面部及手肿胀、聋哑、呼吸困难、黄疸、哭泣低、头发稀少干枯、四肢不温、脐疝、腹胀便秘、骨骼发育迟缓、胫骨上端及胸骨下端没有骺骨等。
婴儿甲状腺功能低下症状，主要是反应迟钝，怕冷，骨骼发育不完全，智力低下，身材矮小，体温低，不爱动，嗜睡，便秘，皮肤干燥，食欲下降，出现这种症状有可能是因为遗传的原因导致甲状腺不发育或发育不完全。
治疗主要是补充甲状腺激素，即左甲状腺素钠片，可以通过系统的治疗2-3年之后，可以考虑停药1个月，再来检测甲状腺功能，假如甲状腺功能正常，也可能是暂时性的先天性甲状腺功能减退，也可以停药可以定期监测。
婴儿甲状腺功能低下的情况下，就会造成孩子的生长发育，出现呆小症，不光会造成身高的发育。还会造成智力的生长发育。要及时到医院去检查一下甲状腺功能，要是有甲状腺功能低下的问题，可以服用药物进行解决。
