病因治疗：主要是针对引起脑积水的原因进行处理，例如切除引起脑积水的肿瘤，清除引起脑积水的血肿，摘除引起脑积水的脑囊虫等方法；脑脊液分流手术：手术目的是建立脑脊液循环通路，解除脑脊液的积蓄，兼用于交通性或非交通脑积水。
手术治疗，减少脑脊液形成，如采用侧脑室脉络丛切除或电灼术。主要用于交通性脑积水，特别在分流手术失败或不适合进行分流的患者。目前在内镜下进行电灼，可以明显减少手术并发症的发生；中药疗法：进行辨证施治，其治疗原则是急则治其标，多祛湿利水，缓则治其本，温补脾肾是其关键。
脑积水的原因比较多，有正常颅压脑积水、梗阻性脑积水、交通性脑积水。可能是脑脊液循环通路障碍，或者脑脊液分泌过多、吸收过少等各种原因导致。如果有梗阻，就要解除梗阻，看是不是占位性病变导致的梗阻，如果是占位性病变导致的梗阻就要去除。如果是正常颅压脑积水，就要做脑室腹腔分流手术，把脑脊液引流到腹腔，减轻这些症状。
脑积水别人在手术之后很容易会出现分流系统堵塞的后遗症，这种后遗症的发生一般是比较多见的，有大多数脑积水病人在手术之后都会有这种后遗症发生。脑积水病人在手术之后还有可能会出现感染的后遗症，这种后遗症的发病率是比较低的，主要是由于病人在手术之后没有做好护理而导致发病的，而病人一旦有感染的后遗症发生，主要就是会出现脑室炎和腹膜炎这两种后遗症发生。
新生儿脑积水后遗症有失明、脑发育不良等。
新生儿脑积水如果不积极治疗可能会后遗症，比如视力下降，甚至失明；压迫脑组织，造成脑发育不良、脑萎缩、脑软化、脑瘫等情况。患者需要到医院进一步检查并治疗，以免影响健康。
患者平时应该适当到户外活动，加强体格锻炼，养成定期体检的好习惯，每年或每半年一次，有利于身体恢复。
