使血中胆固醇水平升高，嗜睡不醒，头痛或头晕，烦躁不安。心脏血管方面，会引起血压高，心动过速。最常见的是消化系统，有食欲不振、恶心、呕吐、腹泻或是便秘等。此药副作用虽然比较多，但不一定都会出现，与个体差异有关，有轻有重。
吃盐酸帕罗西汀片是不可以短期内怀孕的，最好是间隔3-6个月怀孕。
盐酸帕罗西汀片是一种抗抑郁症药物，女性服用药物后，可能会导致早期胚胎的发育受到影响，可能会胚胎停育、胎儿发育畸形等，从优生优育的角度上讲，女性在备孕期间以及怀孕后的三个月内不应该服用此类的药物。
建议女性在怀孕三个月的时候，注意调整身体，避免烟酒、细菌、药物、放射线等不利影响，保持营养均衡，增强身体的抵抗力和免疫力，有利于积极的备孕，保证怀孕后胚胎的生长发育。
长期使用盐酸帕罗西汀片可能会出现胃肠道不适，如恶心、厌食、腹泻等。亦可出现头痛、不安、无力、嗜睡、失眠、头晕等。少见不良反应有过敏性皮疹及性功能减退。然停药可见撤药综合症，如失眠、焦虑、恶心、呕吐和胃肠胀气；其他还有乏力、性功能障碍(包括阳痿、性欲下降)副作用。低钠血症者较少见，主要发生在老年人，通常在停药后迅速恢复。而且在维持治疗期间药物剂量未变，也没有任何心理社会应激事件，却可能出现抑郁复发。
可能是由过度紧张引起的。可以服用治疗早泄，仍有一定疗效。平时，注意加强锻炼，放松心情，避免过度紧张，多做提肛运动，这有利于改善性生活时间。必要时，去正规医院做泌尿科检查。
此药服用2到3周。之后再根据病人的反应看是否需要调整剂量，每周以10mg量递增，每日最大量可达50mg/d。在强迫性神经症患者中，正常剂量20mg/日，每周以10mg量递增，每日最大剂量可达60mg。惊恐障碍患者因其早期症状可能加重，从10mg/d剂量开始，根据病人的反应，每周以10mg量递增，正常剂量为40mg/日，最大剂量可达50mg/日。
可以用于抑郁症的临床治疗，也可用于强迫症、惊恐障碍、社交焦虑障碍等的临床治疗，足量足疗程都可以有不错的效果。可能会有撤药反应，在撤药的时候应该缓慢进行。该药副作用主要包括恶心、腹泻、失眠、不安和性功能障碍等，多数副作用持续时间短，多为一过性的，患者多能耐受，大概十天左右就会慢慢消失。