新生儿病理性黄疸治疗上应针对病因进行药物、光疗等方案。常用治疗方案：如果为轻症黄疸，只需要吃药物治疗，监测胆红素就可以。如果黄疸重，需要光疗，就是蓝光治疗，若已确诊为母子血型不合溶血症时，考虑应用免疫球蛋白，如果病因是婴儿肝炎综合征，要护肝治疗；如果是感染引起，就要抗感染治疗；如果是胎粪排出延迟，行灌肠治疗；极重度黄疸需换血治疗。
生理性黄疸是足月出生的孩子，出生半个月内会消退，早产的孩子可能时间长一些，可能会满月内会退黄。
若黄疸持续时间超过生理性黄疸时间可能是病理性黄疸，或生理性黄疸时限内黄疸值很高，伴有其他疾病，如新生儿肺炎、新生儿颅内感染等，可能是病理性黄疸。病理性黄疸主要表现在黄疸值高，用退黄药物治疗效果不佳，或用药好转后再次有明显黄疸，黄疸反复出现，时间久，数值高，可能就是病理性黄疸。病理性黄疸常见原因是巨细胞病毒感染、胆汁淤积症导致器质性疾病。
由外科中肝胆管结石引起胆道梗阻，胆道扩张，这种病理性的黄疸一般在10-15天可逐渐消退。但在急性发作期，造成胆道完全梗阻，结石不能去除，炎症、水肿不能消退，黄疸会逐渐加深，造成急性化脓性梗阻性胆管炎，会在25-30天逐渐消退。
新生儿黄疸不一定是病理性黄疸，也可能是生理性黄疸。
生理性的黄疸是所有的婴儿都会发生的，通常会出生后在2-3天左右的时间里出现，一般4-5天后就会消失，很少会再发生。病理性黄疸一般在出生后24个小时之内就会发生，这种情况会持续很久，容易反复。病理性黄疸容易引起神经和大脑的损伤。除了黄疸，还会表现为精神衰弱、昏昏欲睡、双眼斜视、肢体僵硬、痉挛等症状。
病理性黄疸是指新生儿在出生24小时内就出现黄疸或黄疸发展过快，持续时间较长，甚至伴有贫血，体温不正常，吃奶不好，呕吐，大小便颜色异常。有的是黄疸已消退或减轻后，又重新出现和加重，多属于病理性黄疸。其临床症状主要表现为黄疸症状发展快，程度重且长，足月儿2周左右不消退，早产儿3周左右不消退，长时间黄疸后消退之后又重新出现。
新生儿在一天内24个小时内可发生病理性黄疸，一般在2-4个星期左右。病理性黄疸比生理学性黄疸要严重得多，全身各个地方都会出现黄色，要到正规的医疗机构进行检查。病理性的黄疸会反复发作，病情逐渐加剧，表现为躁动、食欲差等。因为病因的差异，因此症状常会伴有是原发病的相关表现，例如败血症、肝炎、先天性胆管关闭等。
