麻黄主要毒副作用来源于麻黄当中的麻黄碱。麻黄碱为拟肾上腺素药，可以兴奋平滑肌，出现皮肤、黏膜和血管的收缩，导致心律失常、头晕、头痛、失眠、紧张、兴奋、烦躁不安、出汗、尿量增多、恶心的症状。
孕妇不可以用麻黄：
女性的怀孕期间麻黄的使用还是要慎重的，因为麻黄在所有的中药类型中属于比较猛烈的一种，这个在使用了之后有可能会加重身体的代谢负担，作用于心脏，使心率增快，心输出量增加，血压升高，心肌耗氧量增加，不利于心脏病人。同时也作用于血管，引起血管收缩，也导致血压升高。麻黄碱也作用于子宫平滑肌，引起平滑肌兴奋性增加，容易导致流产。
常见的副作用是震颤、心悸、过量可中枢兴奋、失眠、出汗、发热感和血压升高。平时饮食要清淡点，不要食用辛辣的食物，还有要注意休息，多喝点热水，还要多注意一下卫生环境。
含有麻黄碱的感冒药包括有酚麻美敏片、美扑伪麻片或者氨麻美敏片等。麻黄碱放在感冒药中主要的作用是起到一个收缩鼻黏膜下的毛细血管，减轻鼻腔黏膜充血、水肿，减少鼻塞、流鼻涕打喷嚏的现象。麻黄碱同时还能够舒张支气管平滑肌，缓解哮喘出现的这些喘息。
麻黄碱和伪麻黄碱在结构上是镜像的对方。这是因为有一个手性中心连接到这两种物质的醇基碳原子。由于其1位和2位为手性碳原子，故此类化合物共有4种异构体，即D-麻黄碱和L-(+)-麻黄碱以及L-(+)-伪麻黄碱和D--伪麻黄碱。因为分子中有两个手性碳，故有四种旋光构型体，左旋麻黄素溶于水，乙醇，不溶于乙醚，氯仿。右旋麻黄素无味，溶于乙醇，乙醚。右旋麻黄碱又称伪麻黄碱。的化学性质很多都是相反的。
