人工流产第五天肚子疼腰疼是急性腰腹部扭伤、流产不全等原因。具体分析如下：
人工流产第五天时肚子痛腰痛，要考虑是否为急性腰腹部扭伤，也很可能会导致腰痛和腹痛的症状，患者要注意多休息。也要考虑是子宫腔内残留胚胎组织，流产不全导致的，刺激子宫内膜，就很可能会出现不适症状，建议患者去医院检查，及时清宫手术来清除残留物。
怀孕从早期出现了肚子疼腰疼的情况，引起的原因可能是肠道胀气引起的，这个是正常的表现，另外就是需要考虑到宫外孕的可能的，积极地检查阴道超声，确诊具体的情况以后再进行对症治疗就可以了。
来月经腹痛、腰疼，可能是生理性的，也可能是病理性的。
来月经时盆腔是充血，可能刺激腰部神经导致腰痛，经期子宫内膜脱落会释放前列腺素，因子宫收缩就导致腹痛的情况。若是疼痛轻度可以忍受，症状会在月经干净后会慢慢消失，不用特殊处理。若腹痛、腰疼严重可能是病理性的，如盆腔炎症，月经期间炎症加重导致腹痛疼、腰疼的情况加重，建议在医生指导下用抗炎药物消炎治疗，腹痛、腰疼的症状会随着炎症的消退逐渐缓解消失。
怀孕四十天总是腰疼肚子疼，大部份皆源于姿势的改变。随着妊娠的进展，子宫日益增大，身体重心逐渐向前移，迫使孕妇肩部相应向后移，以保持身体平衡。颈部微屈以弥补并维持头部正直。结果脊柱的正常屈曲度增加，导致脊柱前凸，而造成局部肌肉之拉扯，出现怀孕初期腰痛症状。
来月经肚子疼腰疼在不影响正常工作和学习的情况下是正常的，因为通常在月经来潮前，由于盆腔内有淤血可能会导致小腹坠痛、腰酸困。建议女性在月经期间要注意保暖，如果腰疼的情况比较厉害，可以去医院检查是否合并有其他的疾病，查明病因后对症治疗，在月经期间避免吃辛辣的食物，避免吃生冷的食物，饮食尽量温软易消化，同时避免受凉。
如果患者平时有性生活，出现腰疼、肚子疼、月经推迟的情况，建议患者使用晨尿做早孕试纸测试来排除怀孕的可能，如果早孕试纸显示两条杠，则可能是怀孕导致的；如果出现一深一浅的两条杠，也可能是怀孕导致的。
如果出现一条杠的情况，则表示没有怀孕，可能是内分泌失调、生活习惯不良等因素导致的。
建议患者到医院检查，可以给予抗炎治疗，可以遵医嘱口服黄体酮进行催经。