局部反应和轻度的全身症状。大多数人接种无反应，仅个别儿童注射后，局部出现红肿、疼痛，一到两天内消退。少有发热，一般均在三十八度以下。少数有头晕、头痛、不适等自觉症状。偶有皮疹，血管性水肿和过敏性休克发生率随接种次数增多而增加。不良反应发生率还是比较低的。
乙脑疫苗分为灭活疫苗和减毒活疫苗两类。灭活疫苗，少数人可能出现一过性发热反应，也可出现红肿或皮疹现象，但大多症状较轻不需特殊处理，两天内可自行缓解，对个别出现严重过敏反应的，应及时采取针对措施。减毒活疫苗注射后一般无反应，少数人局部红肿，偶有发热或过敏性皮疹，一般不需特殊处理。
乙脑疫苗建议在5月份进行接种，夏季是乙脑疾病高发的季节，5月份打完乙脑疫苗后一个月左右基本身体就有抗体，因此这是比较合适的时间，7-9月不太适合打乙脑疫苗，这时候是乙脑高发的季节，接种是不太合适的。乙脑疫苗多注射两针，注射完可能会有发烧的情况，这是需要注意的。
如果条件好的，可以打免费的，效果可能比较好一些，接种乙脑疫苗的原因是为了预防感染乙型流行性乙型脑炎的，是很有必要给孩子接种的。给孩子接种相关疫苗就可以了，一定要按照疫苗卡上的要求，按时给孩子接种相关疫苗来预防感染。
一般情况下，宝宝接种了疫苗之后会发热，要根据发热的具体情况进行分析，比如咳嗽、打喷嚏、流鼻涕等，可以考虑是上呼吸道的疾病，可以口服小儿氨酚黄那敏颗粒、小儿头孢克肟、鲜竹沥口服液等药物进行治疗；宝宝出现腹泻、呕吐等症状时，可以口服妈咪爱、蒙脱石散、乳酸菌素片等药物进行治疗。体温38.5摄氏度以上要吃退烧药，没有明显的表现，可能是因为打了一针流感引起的发热，可进行物理降温。
一般来说，打乙脑疫苗后发烧39度的原因如下：
疫苗的副作用可能会导致患者出现打乙脑疫苗后发烧39度的情况。正常情况下，发烧症状的时间不会持续太久，基本会在3天内缓解。口服布洛芬混悬液，多喝温水以及温水擦拭身体的物理降温方式都可以有效改善症状。
日常生活中，患者应注意多休息，避免过度劳累，保持心态平和，不要有太大的精神压力，还要注意个人饮食，多吃新鲜的蔬菜和水果，保证营养均衡，有利于身体恢复。
