肛周脓肿形成的原因多数是由于肛窦炎感染未得到及时控制，而波及到肛门直肠周围软组织，从而形成局限性脓肿。肛窦一旦感染后，会引起肛门腺感染化脓，炎症向肛周间隙内扩散形成肛周脓肿。
治疗肺脓肿的药物主要有青霉素类药物和大环内酯类药物。肺脓肿确诊后要及时进行治疗，首先要用抗生素进行积极的治疗，抗生素要覆盖厌氧菌，比如青霉素、甲硝唑、奥硝唑、克林霉素、林可霉素等，另外还要加强痰培养的检查，可以根据药敏试验更换抗生素。其次要重视痰液的引流，主要有体位引流和化痰的药物，氨溴索、桉柠檬碱、乙酰半胱氨酸等。如果出现高热症状，可以口服一些解热止痛的药物，比如美林、洛索洛芬钠、阿司匹林等。如果病人有休克症状，应进行静脉输液，并应用血管活性药物。
需要应用抗生素治疗来促进炎症消退，另外可以进行细菌培养和药敏试验检查，检查结果选择敏感的抗生素，如果出现进一步加重，需要进行手术处理，切除脓肿，导致出现脑炎或脑膜炎，可以进行腰大池引流治疗。
肛周脓肿早期可以用抗生素来控制进一步发展，但是如果已经形成脓肿了那就不是吃药的问题了，那就需要手术治疗了。可以做肛门镜检查，以明确具体诊断，方便进一步治疗。
三岁幼儿，出现肛门部位疼痛，检查患有肛周脓肿，主要与细菌感染引起的，容易引起肛瘘，败血症等并发症。切开排脓属于暂时性应急处理。可排出脓液，迅速减轻症状，但不能代替它，一般约需3个月左右，待瘘管形成，内口明确，再行治疗需要局部应用抗生素控制感染，服用缓泻药物，缓解大便时疼痛，脓肿形成需要切开引流。
