治疗腱鞘囊肿的药物有多种，如双氯芬酸二乙胺乳胶剂、鱼石脂软膏等。
1.双氯芬酸二乙胺乳胶剂：双氯芬酸二乙胺乳胶的主要成份是双氯芬酸钠，它能抑制环氧化酶，降低前列腺素的合成，并能抑制脂氧酶，降低白三烯、缓激肽等的产生，具有镇痛、抗炎、解热的功效，对腱鞘囊肿、肌腱鞘囊肿的疼痛、红肿等病症有一定的疗效。
2.鱼石脂软膏：鱼石脂软膏的成分是鱼石脂，具有抑菌、抑制分泌、消炎、消肿、轻度镇痛等作用，可以用于治疗腱鞘囊肿。
腱鞘囊肿采用手法挤压，可以采用以下方法：一是用大拇指按压，将腱鞘囊肿固定。第二个动作是用另一只大拇指，把它按到对面的大拇指上。在这个过程中，一旦被挤压，就会有一种力不从心的感觉。术后，肌腱鞘囊肿会逐渐消失。
患者还要注意的是，在腱鞘囊肿被挤压后，还要加强局部的清洁卫生，避免出现感染的情况，必要时，需要遵医嘱口服阿莫西林胶囊、头孢克肟分散片等药物。
一般情况下，腱鞘囊肿是关节囊、肌腱的退变或磨损形成的，具体内容如下：
腱鞘囊肿是一种比较常见的病症，该病症可以发生于患者身体的多个部位，其中，腕关节手背桡侧通常是腱鞘囊肿的多发部位。如果患者的腕关节反复进行运动，可能会导致关节囊、肌腱出现退变或磨损，从而成单向的瓣膜，此时，滑液通常无法流出，会逐渐堆积而形成腱鞘囊肿。
腱鞘囊肿具体发病原因不明，可能和长期外伤有关。可为损伤、过度劳损（特别可见于手和手指的关节处）、骨关节炎、某些系统免疫疾病。较多出现在需要长时间反复做一些关节活动的人身上，例如打字员和切菜工，经常看到的患处是手腕，手指和脚的部位。
如果患者发生腱鞘囊肿，出现疼痛症状，可以采取药物治疗，也可以到医院挤出脓液，帮助囊肿消除，必要时需要采取手术治疗。
腱鞘囊肿需要治疗的，可以采取保守治疗，也可以吃药局部热敷按摩进行治疗，注意腱鞘囊肿的病情变化，另一种是，腱鞘囊肿影响活动，并出现疼痛，难以忍受，可以采取手术治疗。
