治疗腱鞘囊肿的药物有多种，如双氯芬酸二乙胺乳胶剂、鱼石脂软膏等。
1.双氯芬酸二乙胺乳胶剂：双氯芬酸二乙胺乳胶的主要成份是双氯芬酸钠，它能抑制环氧化酶，降低前列腺素的合成，并能抑制脂氧酶，降低白三烯、缓激肽等的产生，具有镇痛、抗炎、解热的功效，对腱鞘囊肿、肌腱鞘囊肿的疼痛、红肿等病症有一定的疗效。
2.鱼石脂软膏：鱼石脂软膏的成分是鱼石脂，具有抑菌、抑制分泌、消炎、消肿、轻度镇痛等作用，可以用于治疗腱鞘囊肿。
一般情况下，腱鞘囊肿口服消炎镇痛的药物进行治疗。
病情急性发作的时候可能会产生疼痛，患者可以口服消炎镇痛的药物来消肿、止痛。急性期过后，如果病情严重需要通过手术来切除腱鞘囊肿。
如果不采用手术切除的方式，腱鞘囊肿容易反复消失和存在。
建议治疗期间，患者应该规律作息，保证充足的睡眠，避免熬夜，除了针灸，还可以通过按摩、理疗等方式血液循环，缓解症状。
脚背部腱鞘囊肿足背腱鞘囊肿吃的药有扶他林片、塞来昔布和布洛芬等。
从实质上看，主要是反复遭受慢性劳损和摩擦所致，良性肿块形成，任何一种药都不能使其根除。如症状不明显，无需特别治疗，但切忌局部受摩擦和挤压。若腱鞘囊肿渐大，甚至已表现为神经血管受压、局部肿胀症状，可主动采用外科手术进行切除，能有效改善症状。
腱鞘囊肿容易粘连，渗出造成疼痛。可以口服扶他林等非甾体类抗炎药，缓解疼痛，缓解炎症渗出。腱鞘囊肿内，滑膜渗出，腱鞘增生，影响血液循环。可以口服血府逐瘀胶囊等活血化瘀药物，减轻积液渗出，促进血液循环，减轻粘连。如果腱鞘囊肿比较严重，导致粘连，已经影响到活动或者疼痛非常严重。这时候可以选择镇痛治疗，也可以注射激素类药物和局麻药物。
腱鞘囊肿并无特效药物。
腱鞘囊肿主要是由外伤，慢性劳损等引起的。治疗方法主要有保守治疗和手术治疗两种。腱鞘囊肿的保守治疗方法是挤压破裂囊肿，疱液被身体吸收，可逐渐消除但病症易复发，且容易出现感染的症状。手术方式是切除腱鞘囊肿，减少复发的机会，有效地的治疗病症，帮助患者恢复身体健康，避免影响患者的腱鞘功能。