一般情况下，良性卵巢囊肿可能会导致CA125轻微升高，具体分析如下：
良性卵巢囊肿有可能会导致CA125出现轻度升高，一般是由于卵巢巧克力囊肿导致的。结合病史，如果有痛经的病史并且进行性加重，还可能会不孕不育，另外半个月再复查的时CA125值没有改变，基本上就可以考虑是卵巢巧克力囊肿。
对于卵巢巧克力囊肿患者，建议尽快手术治疗，术后为了预防复发还要用相应的药物，连续用药三个月经周期或半年的时间。
CA125不是一项特异性的指标，所以它也可由其他的病因引起升高，例如一些炎症，乳腺炎等均可引起CA125的升高。而CA199偏高也可有组织病变，恶性肿瘤，病变时分泌亢进所形成CA199的指标升高。但CA125和CA199一起偏高，可能是存在某些良性病变，例如消化道炎症，肝硬化等。
卵巢囊肿会导致CA125增高，CA125是一种常见于卵巢上皮癌的肿瘤标志物，这种病人在检查时会出现CA125高于正常值。但在某些特定的条件下，也会引起盆腔炎、子宫内膜异位症、卵巢囊肿等疾病，特别是50岁以下的女性，CA125增高并不一定就是卵巢癌。女性50岁以上的女性，CA125水平增高，需要密切关注。
CA199升高从肿瘤标志物的水平，并不能够确定患者是否存在癌症问题的，偏高的状态只能说明可能存在癌症的风险，针对该标志物所指向的相关区域，接受进一步的影像学检查。
ca125升高，可能是由于卵巢巧克力囊肿，子宫内膜异位症，盆腔炎，附件炎，腹膜炎等良性疾病导致其升高，尤其是子宫内膜异位症可以导致其明显升高，也可以是卵巢癌，或者是肺腺癌，导致其升高，正常的人也可以轻度的升高。ca125是肿瘤标志物，有假阳性和假阴性结果的存在，它是肿瘤参考指标。
