肠道菌群失调的话，恢复需要大概1到3个星期的这样的一个时间来进行调节，肠道菌群如果受到破坏以后它是可以自行恢复的，但是可以服用一些益生菌加快这样的一个恢复，时间缩短，这样的话能够使人体肠道菌群尽快得到一个正常的水平。平时应该要注意饮食，要以清淡为主，不吃辛辣油腻、生冷、刺激性的食物，多吃一些温热易消化的饮食。
新生儿肠道畸形的病人，要对出现腹水或腹膜炎的患儿行腹腔穿刺放液。对极低体重或有肠穿孔的患儿采用腹腔引流结合内科治疗可作为一种有效的临时措施。若引流液污浊或腹腔内出现脓肿等需开腹手术。
注意宝宝不排便时的症状，会不会出现腹胀、烦躁、易怒等症状，如果可以正常饮食，但是长期不方便，是因为孩子吃得少，消化能力强，虽然会有少量的食物残渣，但还没有达到足够的排便量，所以会有好几天的不适。但是要注意孩子在第二次排便时有没有排便困难。如果第二次排便困难，患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。
一般情况下，新生儿胃肠道畸形的症状可能有呕吐、腹胀等，具体分析如下：
1.呕吐：如果存在新生儿胃肠道畸形的情况，在早期的症状可能不是特别明显，但在出生后两周左右，可能会逐渐出现频繁呕吐的症状，每次食奶后就呕吐。
2.腹胀：新生儿胃肠道畸形，如果存在其他畸形，如肠闭锁、环状胰腺等，可能会导致新生儿出生以后就腹胀。
新生儿胃肠道疾病会表现出的症状如下：
一、孩子在吸食母乳后会出现消化不佳的情况，会导致宝宝肠胀气的情况，会表现出心情烦躁、频繁哭闹等情况。
二、新生儿不会表达出自身情况，如果发现孩子不睡觉、腹部有饱胀感、不进食、哭闹等情况，考虑孩子患有胃肠道疾病。
三、孩子出现频繁拉肚子的情况，且大便时出现水便较多，需要及时前往医院就诊，明确病因后对症治疗。
