神经外科治疗的疾病主要包括中枢和周围神经系统，以及神经系统表面的附属结构的疾病，比如从脑部来讲，包括各种类型的颅脑的肿瘤、脑出血，以及脑部的感染、像脑脓肿，脑部寄生虫，以及脑部的功能性的疾病。
神经内科。首先需要明确是否存在外伤情况，如果存在外伤就需要神经外科检查。如果只是单纯头痛就是神经内科。头痛疾病中的一个症状，导致头痛的病因很多，如脑神经疾病、颅脑外伤或肿瘤、青光眼、鼻窦炎、贫血、感冒或感染性疾病等都可以引起头痛。引起头痛的原因很多如神经性头痛，血管性头痛，紧张性头痛，偏头痛或者局部五官科疾病引起的，需要根据病史和相应的体检像脑血流图，脑电图或者脑CT甚至内分泌检查确诊。建议去神经内科进行检查，然后根据症状线索查找病因，根据病因转入相关科室检查治疗。
神经外科一是指中枢神经，脑组织、脊柱、脊髓等疾病通过外科手段来治疗的科室。颅脑疾病可以基本上分4大块颅脑外伤。例如车祸伤、颅骨骨折、脑挫裂伤、脑血肿。血管性疾病。例如动脉瘤、动静脉畸形、烟雾病。功能性疾病。例如三叉神经痛等。脑肿瘤。例如脑膜瘤等肿瘤性疾病。
植物神经紊乱主要是大脑高级神经中枢和植物神经功能失调，继而出现一系列的神经系统症状如头疼、头晕、恶心、失眠、记忆力减退等，因此植物神经紊乱即有神经系统症状，又有心理疾病的致病因素，看病挂神经内科。
包括脑部的疾病和脊柱、脊髓的疾病。脑部的疾病包括各种颅脑外伤、脑血管病（包括脑出血、动静脉畸形、动脉瘤）、各种脑肿瘤、先天发育性疾病（脊髓空洞、寰枕畸形）、颅内感染、功能性疾病（三叉神经痛、面肌痉挛、帕金森、癫痫、肌张力障碍等）。
神经外科主要是治疗脑肿瘤，脑血管病和功能脑病等的科室，其中又细化出了功能神经外科，主要是采用手术的方法修正神经系统异常的分支，又称为生理神经外科或应用神经生理学，它主要是利用手术针对特定的神经根，神经通路和神经元群等进行治疗，改变其病理过程，重建神经组织的正常功能。
