副作用是使得血压升高、心率加快、口干、心悸、腺体分泌减少、瞳孔散大、尿液储留，减少炎症的渗出，减少细胞在第三间隙渗出。会导致患者口渴剧烈、呼吸急促、心动过速，甚至诱发心律失常。
盐酸消旋山莨菪碱有抑制腺体分泌作用，可以用于多汗的治疗，也可以减少胃酸分泌，可以解除平滑肌痉挛，可以用于治疗胃肠道绞痛，山莨菪碱可以改善微循环，用于休克导致的微循环障碍的改善，也可以用于有机磷中毒。
脾氨肽用于治疗细胞免疫功能低下、免疫缺陷和自身免疫功能紊乱性疾病。如果经常发病，体质弱者，可以服用。常见过敏引起的皮疹等不良反应。平时给宝宝多喝水，多吃蔬菜水果，营养均衡，荤素搭配，适量活动，增强机体抵抗力，天气变化注意增减衣物，尽量减少着凉感冒。也可以适量吃脾氨肽。
脾氨肽口服液是含多肽氨基酸和多核苷酸混合物的溶液，有提供机体免疫力的作用。婴儿一般连续吃药3周是效果最好的，无副作用不用担心。过敏体质建议脾氨肽口服液和地氯雷他定糖浆同时配合吃药对减少过敏的复发是非常好的。海鲜和鱼虾蟹类不利于疾病恢复，要控制量。
一般来说，寡肽和酸不可以一起用，以免刺激皮肤。具体内容如下：
酸包括果酸、水杨酸等，能够起到祛痘的效果，通常寡肽和酸不可以一起用。寡肽能够促进皮肤基础代谢，平复皮肤毛孔皱褶，还有一定祛除痘印的功效。如果寡肽和酸一起用，不但不能起到较好的治疗效果，反而容易导致酸性物质的活性增强，进而刺激皮肤。
建议使用者用寡肽和酸时，间隔3-4天的时间，以便达到较好的美容效果。
复可托脾氨肽口服冻干粉的适应症包括细胞免疫缺陷或者免疫功能低下造成的（呼吸道感染，带状疱疹，肺结核等疾病）的治疗。脾氨肽冻干粉主要是改善人体免疫功能，广泛应用在呼吸科，皮肤科，甚至相关传染科等。
