由于药物引入机制及价格因素的影响，绝大多数慢性乙型肝炎患者的抗病毒药物是恩替卡韦，尽管恩替卡韦的耐药发生率低，治疗5年，耐药发生率仅为1.2%，但是随着治疗年限的增加，耐药发生率也会逐年上升。
出现耐药，要再一次进行检测，寻找新的治疗靶点，寻找耐药的原因，如果能发现有新的靶点存在，再根据新的靶点选择新的靶向治疗药物。再进行肿瘤的基因检测联合肿瘤标本进行检测，联合肿瘤病人的外周血进行血液活检，寻找治疗靶点。
如果9291耐药后，可能需要选择其他方式进一步治疗，临床疾病可以根据病情选择生物技术治疗或者是传统中药技术治疗，另外也可以选择药物化疗，具体还是需要结合病情选择确定。
9291耐药后最好做基因检测，而且尽量要做全基因检测，有助于发现病情的突变，对于今后的指导用药有很大的帮助。如果没有条件做基因检测，而且体质还好，可以使用化疗的治疗方式，耐药以后要先观察自己的体感，出现骨转，脑转的情况，控制的好也可以选择联药，还可以选择使用中药，要保障最基本的生活，可以吃可以睡，不能让身体消瘦。
如果并没有明显的症状，就可以接受立体定向消融放疗或者继续服用，如果有症状但是脑转移或者病灶孤立的全身转移，再进一步医治。放松心情，不要压力太大，保持良好的心态，注意休息。
靶向药物耐药之后并不是一定很可怕的，因为还有可能选择其他靶向药物或者再次应用化疗可能也是有效的。靶向药物在应用一年或者更长时间之后可能会出现耐药，这种可以选择二线或者三线的治疗方案。
