双肾囊肿不一定是多囊肾。多囊肾属于遗传性疾病，最常见的遗传方式是常染色体显性遗传，病人有双肾囊肿，两侧肾脏超过3个囊肿，同时有血缘关系的亲人中有类似的疾病病史，再合并多囊肝、多囊胰腺、肾衰、脑血管畸形等，基本可以诊断为多囊肾，否则囊肿数目再多也不能诊断多囊肾。
肾囊肿与多囊肾的区别主要是发病原因不同，多囊肾是一种先天性遗传性疾病，与肾小管梗阻有关，或者与肾单位不同部位的局部扩张有关，而肾囊肿是一种后天性的疾病，它的发病机制是一段扩张的肾小管逐步增大，形成囊肿。
肾囊肿和多囊肾是两种不同的疾病，一个是后天性的；另一个是先天性的。肾囊肿是一种后天性肾脏结构异常，在成人中非常常见，而且随着年龄的增长发病率会越来越高，大部分情况下对肾脏不会产生影响，只要定期随访即可。
平时能够积极的处理并发症，尿路感染，结石，高血压及肾衰竭等，则可明显延长寿命。也与个人体质有关，有些人在40岁之前就出现有肾功能减退，半数以上的在70岁时仍能保持肾功能，个别患者80岁也能保持肾脏功能。
多囊肾的情况一般是遗传的，而且随着年龄的增长会变大变多，还会出现腰部疼痛血压升高，肾脏B超结果异常等问题，多囊肾的遗传概率还是很高的，有多囊肾的女性为了孩子的健康，最好不要怀孕。如果非要孩子，建议多囊肾患者要偏食，饮食尽可能多样化，多吃高蛋白优质蛋白食物多吃蔬菜水果。
肾囊肿和多囊肾当然会有明显的区别，多囊肾是一种遗传性疾病，而肾囊肿是非常常见的一种疾病，如果诊断为肾囊肿，一般对人体不会有什么太大的影响。那如果是多囊肾，有可能会导致慢性肾功能不全，对人体的身体影响是非常大的。
