一般来说，腱鞘囊肿完整切除后会复发，但复发的概率很低。
复发的原因可能是手术时医师经验不足，未将囊肿完整切除，也有可能是囊肿在附近部位再次长出。通常临床当中观察将囊壁完整切除后同样的部位再次长出的概率非常低，但是有可能复发，只是复发的概率很低。
此外，建议患者治疗期间要多休息，不要干重体力活，以免加重病情，同时也要保持清淡的饮食，少吃有刺激的食物，如辣椒、洋葱等。
肌腱鞘囊肿的反复发作有以下因素。
一、腱鞘囊肿一般位于身体表面较为凸起的位置，易着凉。感冒，常会导致反复。
二、这些部位长期被压迫，长期摩擦，都有可能导致反复发作。
三、在恢复期间，病人没有按照医师的指示做任何的制动和休息。如果太久的负压运动，很可能会导致疾病的再次发作。
建议患者及时就医，在医生的指导下对症使用药物或者采取手术进行治疗。
腱鞘囊肿火针有复发的可能。
腱鞘囊肿若无明显症状，无需特别加工，留意休息即可，忌过度锻炼，切忌反复揉搓按摩局部。如果患者发现自己的肌腱发生炎症或者肿胀时，要及时就医，不要盲目用药，以免延误病情，导致更加严重的后果。若腱鞘囊肿渐大，甚至有疼痛等表现，火针可用于治疗，但该疗法存在一定复发机会。
此外，腱鞘囊肿患者应该避免长时间摩擦患处。
腱鞘囊肿手术治疗后还有可能会复发。
腱鞘囊肿的产生与工作和体育相关，如果经常屈伸腕关节，很可能导致腕部的腱鞘囊肿和腱鞘炎，反复的屈伸踝关节和反复的跑步等疲劳的运动都会导致腱鞘囊肿或腱鞘的感染，在手术完全的切除之后，在一段时间之后，如果进行一系列的工作和锻炼，不小心，仍然是疲劳的反复的运动，导致了肌肉的反复屈伸，导致了局部的炎症，从而导致了囊肿的产生。所以在做完了腱鞘囊肿之后，不注意经常做重复的动作，再做疲劳的活动也会导致肌腱鞘囊肿的再次出现。
腱鞘囊肿手术后复发可以进行二次手术。
术后出现的肌腱鞘囊肿复发，需要进行第二次外科切除。不过，做完这台手术，疤痕粘合的情况并不好。因此，在做完这一系列的手术之后，一定要谨慎地进行分离，避免对周围的神经和血管造成的伤害，术后要多休息，避免出现反复。伤口要及时进行换药和杀菌。要做好局部护理工作，注意休息。
腕部腱鞘囊肿可反复发作，还可能逐步扩大。
腕部腱鞘囊肿成因多可由局部慢性劳损所致。在长时间的使用中，腕关节和手指长期处于不稳定的状态，这样就会造成肌腱组织产生损伤而出现问题，进而引起腱鞘炎。手腕活动度很高，极易造成局部无菌性炎症形成，炎性液体渗出等，激发周围神经引起疼痛，当然，炎性液体外渗可形成囊性包绕，在此条件下，腱鞘囊肿便会形成。当这个时候，肌腱和关节囊被撕裂时，这些积液会流到皮下或者肌肉中，这就造成了腱鞘囊肿的再次增生。
当然外伤，类风湿性关节炎等都可引起腱鞘囊肿。腱鞘囊肿在腕关节处出现时，通常为圆形或者椭圆形的肿块，并且质地较软，没有任何触痛和疼痛感，而且随着年龄增长而越来越严重。对腱鞘囊肿，通常不引起临床明显症状，无需特别处理，若腱鞘囊肿渐大，引起疼痛时可针刺破，将内部液体排出，还可穿刺提取内部液体。
但这一处理办法，腱鞘囊肿复发机会均较多，其中以手术彻底清除最为彻底，但仍然可能复发。
