肾囊肿的形成因素是多方面的，对于单纯性肾囊肿主要是由于肾脏的集合管堵塞，造成尿液分泌受阻，从而逐渐的形成囊性的扩张，引起肾脏囊肿。还有一种多发性的肾脏囊肿，又称多囊肾，多囊肾于先天性遗传因素有关，属于常染色体遗传病。
肾囊肿有可能基因突变也是引起的发病，也有可能是先天遗传因素是肾囊肿最常见的，各种中毒对肾脏的损伤，例如常见的毒物有农药、化学制剂、放射线、污染等，有些感染的原因产生了有利于肾囊肿基因变化的因素，也可以引起肾囊肿。
肾囊肿是有很多发病原因，如果家人亲属有得肾囊肿疾病的，可能会出现基因突变，还有就是，感冒也会导致肾病患者肾脏损伤，肾囊肿是一种比较常见的良性病变，也有可能是身体的抵抗力比较低而造成疾病出现。要提高自身免疫力。
当肾囊肿的直径超过3-5厘米的时候，将会对身体造成一定的伤害，手术切除囊肿刻不容缓。肾囊肿手术就是将囊肿的液体抽出，由原针头注入甲醛溶液，内囊摘除后，外囊残腔用双氧水杀死头节，再用生理盐水冲洗，不用担心，肾囊肿切除是微创手术，没有危险。
孕妇出现肾囊肿是不太严重的一种病症。但是建议密切观察。
肾囊肿，顾名思义，就是肾实质的一种囊性病变，通常为良性病变，若肾囊肿的体积很小，只要经常复查。若患者出现血尿、蛋白尿等肾功能损害时，就应该到医院就诊。孕妇若出现肾囊肿，无明显症状，可暂时不需要办理，甚至更大，亦可于投产后处理。建议定期进行产前检查，明确胎儿和孕妇的身体状态。
