本身多囊肾总是属于先天性疾病问题，一般采用保守的治疗方式，肾脏一般是出现了，没有办法正常的清除体内的废物，给肾脏所带来的异常伤害，如果肾脏没有办法进入体内的废物会造成更严重的尿毒症等情况。对于治疗多囊肾疾病需要患者结合医生的专业治疗来进行诊断。
多囊肾病人出现症状后，尤其有肾功能不全的多囊肾者，仅能存活10年，约每3年血肌酐上升1倍，即血肌酐清除率下降一半，但若血肌酐从未升高过，且无结石、感染和严重高血压，则可存活30~40年。
年轻时肾脏的大小和形状正常或稍大，囊肿的数量和大小随年龄逐渐增加。大多数病例直到40岁至50岁之间肾体积增加到一定程度才出现症状。主要表现为双侧肾增大、肾痛、血尿和高血压。对这种疾病没有具体的治疗方法，主要是控制血压和感染可以有效延缓肾功能衰竭的进展。不适于手术的病人应给予对症治疗。
多囊肾的病人往往是在成年之后发病，往往发病年龄越早活得年龄就会越小，而且病情进展也会越快。针对发病年龄比较晚的，比如有些患者可能在50岁、60岁以后才发病，而且有些人可能病情进展比较缓慢，通过及时的治疗、预防这种并发症的发生，有可能活到80岁。有些患者在多囊肾的末期进行了肾移植手术，有些可能肾移植比较成功、相关副作用比较小的，活到80岁也是可以的。
如果囊肿直接导致了肌酐明显偏高，时候就有必要进行手术治疗了，因为越到后面，肾脏功能影响越大，比较大的囊肿，手术可能起到减压，缓解对附近肝肾组织的压迫作用。
