此药还是有一定的副作用主要是致癌，属于代谢分解物，有潜在的致癌危险，特别是高浓度，会增加癌症的发病率，会增加子宫癌、乳腺癌、卵巢癌的发病率。属于植物性的雌性激素，能补益女性的雌激素的分泌不足，有利于皮肤保持水分和弹性，改善女性，特别是更年期后的骨质疏松。适合30岁以上中老年妇女，特别是更年期的妇女，心血管病人、骨质疏松症者以及卵巢和子宫切除术后的人群使用。
大豆异黄酮中含有天然的雌激素，如果雌激素偏低，可以适当的服用。但是如果有子宫肌瘤，口服雌激素以后就会导致子宫肌瘤增大。建议也可以适当的口服点大豆异黄酮，服用期间定期到医院做彩超，看看子宫肌瘤的变化。雌激素水平正常以后停用就可以了。
子宫肌瘤不宜服用这个药，小于5cm的子宫肌瘤可保守治疗定期复查，子宫肌瘤是女性常见多发的良性肿瘤，发病与体内的雌激素水平有关系，有子宫肌瘤的病患不宜服用含雌激素类的药物及食物，以避免引起肌瘤增长速度过快。
吃大豆异黄酮是会影响月经的。
月经期间不能服用大豆异黄酮片，否则会因雌激素水平升高、子宫内膜得到修复等，导致月经紊乱。女性之所以有规律的月经周期，是因体内的雌孕激素规律性改变，使子宫内膜周期性增厚、脱落导致的。大豆异黄酮片属于植物性雌激素，服用大豆异黄酮片会影响激素分泌、代谢生物学活性、蛋白质合成等，一般体内缺乏雌激素时，可以服用大豆异黄酮片调理。但在经期服用大豆异黄酮片，会使体内的雌激素水平明显升高，很可能影响月经，导致月经量增多、经期延长等。
乳腺增生是由于身体内激素的水平变化引起的，尤其是雌激素水平比较高，有很大的关系，大豆异黄酮含有天然雌激素，所以在患乳腺增生期间，先不要吃大豆异黄酮了。平时要保持心情舒畅，情绪不要有太大的波动。
雄激素高吃大豆异黄酮可以起到补雌激素的作用。大豆异黄酮是大豆中的一类次级代谢产物，也是一种生物活性物质。其结构与雌激素有相似，因此大豆异黄酮又被称为植物雌激素。
