巧克力囊肿的早期症状是痛经，且呈进行性加重，有的也可没有症状，是由于不孕症，去医院检查时才发现的。巧克力囊肿的症状主要是月经量多、痛经、腹部包块，尤其是会出现性前时疼痛出血。
巧克力囊肿的护理要保证充分的睡眠：每天早起早睡，可以使皮肤变得更好，而且卵巢也会更健康。还可以适量喝些红酒：红酒可以促进卵巢活性，从而提高卵子的质量。多吃一些一些豆腐豆浆及豆制品，因为里面含有大量的植物蛋白，可以让卵巢更结实，卵子更健康。
生理性囊肿不需要手术，病理性囊肿通常需要手术来确认诊断并相应地治疗。去正规医院检查做B超。彩色B超，X线检查，腹腔镜检查等先进的诊断技术可用于卵巢囊肿的早期诊断。虽然卵巢囊肿易于恶变，但只要早期发现，早期发现和早期治疗都可以避免。
卵巢巧克力囊肿的危害有：引起月经不调、腹痛、性生活痛等不适症状；造成盆腔器官的粘连；导致弥漫性腹膜炎；引起输卵管阻塞，导致不孕。反胃、呕吐、发烧和腹部剧痛。需要去正规医院专科治疗的。
得了巧克力囊肿，应该及时到医院检查并采用相应的治疗方法进行治疗，比如可以采用药物或手术治疗，及时缓解症状，治好了巧克力囊肿，食欲自然会变好的。但是也可以吃中药进行调理，提高食欲。
主要靠病史、症状和体征。常见的检查有：妇检、超声诊断、MRI、CT、腹腔镜及实验室检查。痛经的症状明显减轻，无阴道出血现象，无下体疼痛现象，这些都可以判断巧克力囊肿是否治好。
