男孩才开始发育，阴茎发育正常。指导：成熟的男性阴茎在勃起状态不少于10厘米是正常的，你才13岁，阴茎发育不正常，不用担心，可以检查激素水平，如果没有异常也不用担心。做包皮或包茎手术时间在孩子10岁左右。另外如果孩子体型较胖的话，也会显得阴茎短小。要让孩子多锻炼身体，适当控制体重。
包皮过长容易藏污纳垢，引起泌尿生殖系统的炎症反应，对生殖器的发育也是不利的。到专业的泌尿外科和男科检查，阴茎海绵体血流多普勒，这样才能做出明确的判断，如果血流下降，是可以进行药物补充的，包皮过长一定要行手术治疗，这样才是最安全可靠的。这样才可以减少手术的风险性。如果阴茎勃起后能够达到十厘米正常的，不是什么问题。
遗传因素由于受到遗传基因的印象，或者在受精过程中造成了基因突变，而导致先天性的阴茎短小。包皮过长，过长的包皮，让阴茎缺乏必要的生长环境，阻碍了阴茎的发育。体寒虚弱身体长时间虚弱，造成怕冷，体内阳气严重不足，只是阴茎不能够完全的凸出，有一部分仍内缩于腹腔内。后天主要是因为睾丸萎缩引起的，另外长期从事微波高温放射性等工作，会对睾丸有一定程度的辐射。
弱精少精导致的原因有精索静脉曲张，隐睾，生殖道感染，自身免疫方面的疾病，内分泌疾病以及不良的生活饮食习惯，接触了有毒有害的化学物质等。可以去正规医院查清造成少精弱精的原因，然后对症治疗。
肥胖导致阴茎短的小该需要合理减肥，还可以通过手术进行治疗。1、既然是因为肥胖症，那就一定要瘦，最重要的是，体重减轻了，阴茎附近的肥肉就会消退，露出的阴茎就会变大。2、如果出现了很严重的问题，或者多次的减肥不成功，需要做的是在做手术的时候，因为切除了大量的包皮，也会让阴茎变得比之前长。建议家长根据小孩的具体情况，选择合适的方式来处理。
内分泌失调会导致阴茎短小。病人可以进行多次阴茎延长手术和假体放置。阴茎在勃起状态下大于12厘米，在虚弱状态下大于6厘米，这些是正常的。许多短阴道直径是先天性原因，可以进行手术。
