一般情况下，甲亢的内科治疗方法是口服药物、放射碘-131治疗等。
甲亢患者可以在医生的指导下口服抗甲状腺药物治疗，如丙硫氧嘧啶片、卡比马唑片等，能够缓解相关症状，促进身体恢复。此外，甲亢患者也可以选择放射碘-131治疗，这种治疗方式是利用碘-131元素，在代谢的过程中所释放出的短程β射线，来破坏甲状腺滤泡上皮细胞，将甲状腺功能逐渐恢复到正常。
甲状腺内储存的激素足够维持1-2个月，所以碘131治疗后短期内，甲状腺内储存的激素释放入血，出现甲亢症状的加重，随着储存激素的耗尽，甲亢症状逐渐好转。碘131治疗甲亢见效的时间大概1月。半年后，如甲亢没有治好，可以再次行碘131治疗。
放射性碘131治疗产生的辐射是比较小的，一般通常局限在甲状腺附近，对于周围的影响不大。做完放射性碘131治疗之后，一般的隔离要求是与普通成人接触距离至少要在1到2米以上。而对于孕妇、老人或小孩等特殊人群，要尽量避免接触。隔离时间需要至少坚持一个月以上，当然如果能够隔离的时间更长，放射线的影响肯定会更小。
治疗之后可能出现放射性甲状腺炎，患者通常表现为甲状腺部位疼痛，也有可能会有体温升高，进一步疼痛加重等。永久性甲状腺功能减退，射线进入体内以后，随着时间延长会有效果递增作用，也就是时间越长，发生甲状腺功能减退症的概率就会越大。
甲亢碘131治疗后，注意禁止吃海鲜类食品至少1个月，禁用碘酒2周。一周内不揉搓按摩甲状腺部位。此类患者可食富含蛋白及维生素类食品除海鲜外，如肉、蛋、奶、新鲜蔬菜等。建议避免或少用咖啡、酒精等兴奋类饮料1个月。建议甲亢突眼患者戒烟或尽量减少抽烟。
碘131，属于一种放射性核素，治疗甲亢主要就是破坏甲状腺滤泡，使甲状腺一过性释放增加，破坏甲状腺激素合成和分泌的场所，那么约50%的患者治疗后会出现甲减，需要终身口服药物。
