主要分为良性的成熟性畸胎瘤和恶性的未成熟性畸胎瘤。良性的畸胎瘤没有什么大的危害，比较小的不需要特殊治疗。如果增长比较大的情况，再考虑手术，腔镜下手术或者传统小切口手术都可以。
巧克力囊肿和畸胎瘤的治疗方法主要是手术治疗。区分两者，其实通过CT扫描往往可以鉴别！典型的畸胎瘤具有三胚层组织，比如脂肪、牙齿、骨骼、毛发、肌肉等，如果CT显示病变内有组织成分，即可确诊为畸胎瘤。巧克力囊肿是子宫内膜异位症，囊肿内往往存在出血，所以CT扫描主要以囊性病灶为主要表现，并且囊内的密度可以比较高，但是没有畸胎瘤的各种组织成分，所以鉴别不成问题的。
畸胎瘤生长速度快，随着胎儿的发育，子宫发展越来越大，可能压迫肿瘤造成破裂，吐血的情况危及生命，而畸胎瘤有可能影响到胎儿发育，引起的早产等现象。需要结合孕周进一步评估风险，如果可以期待，继续妊娠一般是分娩的时候同时剥除畸胎瘤，但是如果考虑风险太大，可能需要终止妊娠。
畸胎瘤怀孕，如果卵巢畸胎瘤比较大，可以手术的，因为怀孕后增长比较快，容易变性。如果不是很大，不要有思想压力。可以定期复查，如果出现腹痛，及时到医院就诊。平时注意多休息。
卵巢畸胎瘤很容易当成囊肿，卵巢畸胎瘤是一个来源于原始生殖细胞的肿瘤，卵巢畸胎瘤是从母体带来的。畸胎瘤主要是有多皮层组织构成，所以当畸胎瘤切下来之后，里面可以有脂肪。
宫腔分离比较轻的病人可以通过药物的方式来进行治疗，如果比较严重的病人需要再次清宫来把组织残留物清理干净，这样才可以有效的缓解病情。宫腔分离主要是在做完流产手术之后，宫腔内还有残留物没有清理干净。
