在妇科疾病方面，高锰酸钾的主要用途就是用来杀菌、抗炎，同时促进伤口的愈合。所以主要就是用于前庭大腺造口手术以后，或者是会阴侧切手术以后恢复不良时来进行坐浴。一般是每天坐浴1到2次，每次坐浴15分钟左右，这时候还可以促进切口处缝线的吸收。其用法就是将高锰酸钾放进温开水里进行稀释，一般是兑成1:5000的高锰酸钾液。
主要用于水体消毒和水产动物的体表消毒，防治细菌性疾病，杀灭鱼类体表外形成孢囊的原虫、蠕虫（如指环虫、三代虫），以及寄生甲壳类动物（如锚头鳋、中华鳋）等。锰酸钾为强氧化剂，遇有机物时即释放出初生态氧而呈杀菌作用。还有氧化毒物和改良水质的作用。
一般来讲治疗包皮龟头炎建议每天至少早晚两次泡洗,每次泡洗3-5分钟比较适合,如果时间允许,建议每天增加泡洗次数,比如说每天泡洗3-4次,能够更有效的去除包皮龟头炎。不能够浸泡时间过长，因为高锰酸钾溶液有一定的腐蚀性，时间长了以后会导致龟头皮肤损伤，引起化学性的炎症感染的表现，反而会加重病情的。平时少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
一般来说，碘伏和高锰酸钾因为其主要成份和作用都不一样，没有太大的区别。
碘伏的主要成份是活性碘，它是一种杀菌、杀菌的药剂，不刺激皮肤和粘膜，可以对皮肤、伤口、会阴处进行杀菌，因此它的应用范围很广，对病菌、霉菌、孢子等都有很好的杀菌效果。而高锰酸钾是一种很强的氧化剂，主要用于会阴、肛门等部位的消毒。
一般情况下，高锰酸钾洗外阴好，但需再根据实际情况对应使用，具体内容如下：
高锰酸钾能清洗女性的阴部。真菌感染、细菌感染、自身荷尔蒙失调等都会导致女性出现外阴瘙痒，高锰酸钾具有杀菌、消炎的功效，能彻底治疗真菌性瘙痒，能有效地控制细菌所致的瘙痒，但对于其它的病症或者是自身的内分泌失调所致的瘙痒，并没有太大的作用。高锰酸钾是一种很强烈的刺激物质，女性的阴部肌肤是非常脆弱的，如果经常使用高锰酸钾，很可能会对肌肤造成伤害。
