阴茎短小根本的原因是遗传基因的影响。另外包皮过长会阻碍阴茎的发育。后天性的阴茎短小，主要是因睾丸萎缩引起，青少年发育期间摄入的锌原素、雄性激素、维生素E和相关蛋白营养不足，缺乏后天能量补充，起不到壮大性器官的作用。
引起阴茎短小的原因主要是阴茎先天性的发育不良，包括包茎，隐匿性阴茎。也有可能是由于海绵体的病变导致海绵体萎缩，海绵体硬化，出现阴茎短小。多见于阴茎外伤，或者是高血压糖尿病。
阴茎短小是指成年男子阴茎在常温常态条件下，其长度与周径小于正常男子的平均值，其主要副作用关键是影响正常的性生活。可以到医院就诊让医生给出明确的诊断。
根据孩子的症状，应该属于假性隐匿性阴茎，有可能是先天发育异常造成的，也有可能是孩子肥胖等原因造成的。对于孩子现在的情况，是不需要进行治疗的，如果青春期后还有隐匿性阴茎的症状，可以手术进行治疗，你家孩子要合理喂养，适当的补充维生素D。
一般情况下，阴茎短小最明显的症状就是阴茎大小没有达到正常范围。建议及时就医，查明病因，对症治疗。具体情况分析如下：
阴茎短小是指在软弱状态下阴茎小于4厘米或在勃起时小于8厘米。阴茎短小属于外生殖器发育不良，主要是由于睾丸组织功能不好，分泌雄激素水平低，导致外生殖器发育迟缓。如果阴茎勃起不超过5厘米，建议做阴茎延长手术。
包皮过长容易藏污纳垢，引起泌尿生殖系统的炎症反应，对生殖器的发育也是不利的。到专业的泌尿外科和男科检查，阴茎海绵体血流多普勒，这样才能做出明确的判断，如果血流下降，是可以进行药物补充的，包皮过长一定要行手术治疗，这样才是最安全可靠的。这样才可以减少手术的风险性。如果阴茎勃起后能够达到十厘米正常的，不是什么问题。
