子宫内膜薄，常见的原因一般是内分泌失调、雌激素不足、排卵障碍和生长激素缺乏等。还有就是子宫内膜的损伤、粘连等，饮食对于该疾病的治疗有着重要的意义。子宫内膜薄，可以多吃黄豆和豆制品，因为大豆含有天然的雌激素，能补充雌激素，含雌激素多的食品一般都是豆制品。
内分泌紊乱性疾病导致的子宫内膜偏薄，因为子宫内膜是在雌激素的作用下出现，增值的，如果患者体内雌激素水平比较低或者雄激素，泌乳素等水平比较高，对抗雌激素，可以出现子宫内膜薄，月经量少的情况。
具体目前尚不明确，但主要与内源性激素雌激素，以及外源性雌激素的作用有关系。内源性雌激素的影响，第一是女性不排卵，子宫内膜长期受雌激素的作用无孕激素的对抗长期处于增值状态，第二是女性肥胖的影响。外源性雌激素的影响，提升激素替代疗法，主要是围绝经期的女性，由于激素缺乏而导致骨质疏松，更年期综合征，用一些雌激素能缓解一些的症状，但是就会导致子宫内膜过厚。
女性在月经来前三天左右，由于高水平的雌孕激素的刺激子宫内膜增生分泌，这时候正常的内膜厚度可以达到10到12毫米左右。如果内膜厚度小于八毫米以下，就称之为子宫内膜偏薄，常常是由于雌激素低下，或者是排卵推迟而导致。
子宫内膜壁薄的原因可能是先天因素，部分女性子宫内膜先天偏薄，或者是宫腔操作，有流产史的女性存在宫腔操作史，易造成宫腔粘连或子宫内膜损失，也可能是子宫内膜结核，结核病毒易侵害生殖器官，造成子宫内膜结核，侵蚀子宫内膜，导致子宫内膜逐渐地变薄。
