巧克力囊肿是会导致不孕的。至少会造成排卵障碍。卵巢巧克力囊肿的形成是由于内膜在卵巢中仍然会出现“经血”症状，但由于在卵巢内无法排出，日积月累就造成了旧血的长期潴留，形成囊包。
建议直接到医院检查，巧克力囊肿复发会导致一系列的妇科问题，包括慢性阴道炎等，如果巧克力囊肿真的复发了，需要引起重视并且再做一次手术切除。平时的时候需要注意个人清洁和卫生，不要和其他人共享洗浴用品。
巧克力囊肿对于女性身体的健康影响还是非常大的，如果不够重视疾病的治疗，很容易影响到身心健康，到医院进行相关的检查，如果症状轻微，可以通过药物缓解症状，进行腹腔镜手术的方式治疗较好。
一般可以通过以下方式改善经血量少和痛经，具体分析如下：
女性经血量少、痛经的症状可以通过多吃红枣、阿胶、桂圆、生姜、黑木耳、洋葱、红糖等活血化瘀、补血的食物，对女性的月经量和痛经都有一定的帮助，如果需要及时去正规的医院就诊，可以口服一些含有雌性和黄体酮的药物，如马雌酮，雌二醇，黄体酮等。在日常生活中要注意保持良好的心态，避免焦虑、紧张等不良情绪。
建议手术治疗。应尽早确定为肿瘤性的囊肿，还是非肿瘤性的囊肿。可依据肿瘤生长的快慢、大小、性状，以及相应的检查，如超声诊断或腹部断层扫描、核磁共振，乃至腹腔镜检查、剖腹探查，可以明确诊断。
