一般情况下，治疗肝内钙化灶疾病的方式有以下几种。
1、药物治疗：如果肝内钙化灶患者，出现腹痛、发热、肝区疼痛等症状，应及时到医院就医，并在医生的指导下服用双氯芬酸、阿莫西林等药物进行治疗。
2、手术治疗：如果肝内钙化灶是因结石、肿瘤等原因引起，可能需要通过结石手术、或是肿瘤切除术来进行治疗。
建议患者及时到医院就医，不要拖延病情，以防诱发其他疾病。
多见于慢性肺部感染，尤其是肺结核感染，经规范化治疗以后病灶吸收不完全，被钙质成分所替代，在影像学上所留下的钙化灶。右肺上叶出现钙化灶多半与结核感染有关，也包括非结核性杆菌，钙化表示不是恶性肿瘤也不是炎症，多为陈旧性病灶。临床动态随访即可，不需要药物及手术治疗。
肝内钙化灶多数是由于慢性肝炎，肝脓肿或者是肝内胆管结石，先天发育异常等因素引起，要是针对原发病进行治疗首先要治疗胆管结石，不要过于担心，通过治疗是可以控制病情的，日常生活中饮食要吃清淡易消化的食物，多吃新鲜的水果，蔬菜，不要吃油腻辛辣难以消化的食物。
肝内钙化灶和肝内胆管结石的区别是肝内钙化灶是指肝脏组织或者是细胞里面的钙化表现，肝内胆管结石说明是肝内胆管里面长了结石。肝内胆管结石会出现远端的胆管出现扩张，肝内钙化灶不存在这样的现象。
肝内钙化灶在肝脏影像学改变中较为常见，亦为较常见肝脏病变之一，通常不是肝炎。
在肝内外胆管系统中发生的结石或狭窄都可以形成肝内钙化灶，但并没有明确区分两者。肝内钙化灶稳定，多数提示过去对肝脏有损害，或具有某些特殊肝脏疾病史。如果在临床上出现了肝功能损害或其他肝实质变化时，都应考虑到肝内钙化病灶的存在，因为这些情况可以导致诊断错误。肝内钙化灶通常无需特别治疗，亦非肝炎之表现。
