一般来说，新生儿流行性腹泻吃母乳比较好。
通常新生儿流行性腹泻不能耐受奶汁，可能需要禁食8~12小时，但是要注意禁食时间不宜太长。症状缓解后可以进行母乳喂养，可以补充患儿所需的所有营养物质，有助于病情恢复，还可以避免奶粉喂养可能会出现的细菌感染。
家长日常要合理喂养新生儿，可以让新生儿适当晒太阳，提高免疫力。
1.婴儿室及新生儿病室的工作人员当入室前应严格执行洗手消毒制度。人员要相对固定，要求有较强的专业知识和经验。 2.室内发生流行性腹泻时应立即消毒隔离，将患儿集中治疗。对接触过患儿的婴儿集中在另一间观察，一旦发病即转入腹泻病房。流行病区应检疫至流行停止。至少应另开一间专收新病儿的病房，其中的工作人员应与流行区分开。 3.病儿及接触过的婴儿大便培养必须2～3次阴性后方允许出院。留下的衣物、被褥及用具必须严格消毒才能再用。出院后的婴儿如在一周内发生腹泻必须到原产院或医院就诊，不可收入其他医院，以免散播。 4.如孕妇发生腹泻应立即与其他产妇隔离，并积极治疗，暂时停止对婴儿抱奶。婴儿也应隔离，并做大便培养至阴性时始解除。 5.积极治疗患婴，（详见小儿感染性肠炎），腹泻新生儿易发生脱水、酸中毒和低血钾症，应及时从静脉补充液体和电解质，纠正酸中毒，下列补充量作为参考：轻度脱水足月儿120～150ml/kg/d，早产儿150～200ml/kg?d；中度脱水足月儿150～200ml/kg?d，早产儿200～250ml/kg?d；重度脱水足月儿200～250ml/kg?d，早产儿250～300ml/kg?d。补充钠、钾、氯离子根据血电解质测试而定，一般情况下生理盐水与10％葡萄糖液之比例在轻度脱水约为1∶2，中度1∶1，重度1∶1～2∶1。治疗酸中毒轻度者在补充液体后会自行纠正，严重酸中毒者在基础液体中增加NaHCO3，第一次量用5％NaHCO31～2ml/kg，待BE或CO2结合力检查结果出来后则根据BE计算。