治疗慢性附睾炎一般可以进行药物治疗、手术治疗。
1.药物治疗：慢性附睾炎主要是由于急性附睾炎没有完全根治，并且经常复发。慢性附睾炎的临床表现比较轻微，检查时会发现附睾部位有硬结，局部有压痛感，附睾不平滑，精索可能会变得更粗，此时可以口服敏感的抗生素，多喝一些水，这样可以有效的缓解病情。
2.手术治疗：但是，如果复发或者是抗感染的药物无效，可以选择手术摘除。
附睾炎在发作期间是不能跑步的。如果是慢性炎症，可以适当的进行锻炼。但是要避免局部的摩擦和挤压。炎症早期采取冷敷或冷水坐浴，可减轻炎性水肿和炎性渗出；中晚期可以热敷或热水坐浴，以促进炎症消散。
对于男性来说，发生附睾炎是比较常见的现象，很多因素可导致炎症的发生，从而给男性健康带来很大的影响，而附睾炎可双侧发生，也有单侧发生的，当附睾发生炎症时，对生育是会造成一定的影响的，不过相对来说，一侧发生附睾炎比双侧影响要小。
慢性附睾炎有普通细菌感染，有结核感染，不知道是哪一种。慢性附睾炎的治疗，可应用药物抗感染治疗，也可配合清热解毒的中药，局部热敷，化脓时切开引流，加强换药，避免长时间站立或行走，是可以治好的。
慢性附睾炎有可能影响生育能力。这种疾病可能会影响精子的质量。如果精子质量差，将会影响未来的生育能力。现在建议进行阴囊彩色多普勒超声、降钙素原和CRP等检查。目的是观察疾病是否由细菌感染引起，并根据检查结果决定是否需要抗生素药物进行治疗。
慢性附睾炎是由炎症感染引起的。疗程相对较长，需要耐心。西药临床应用见效快，易复发，不可治疗，此外，长期服用西药也容易引起耐药性。中医精神博大。清热利湿中药主要用于治疗附睾炎。同时，针灸、按摩、理疗等方法也相当有效。
