巧克力囊肿是子宫内膜异位症，这种囊肿影响怀孕，并且可以出现经期腹痛，会逐渐加重。如果是大的巧克力囊肿或者影响怀孕，可以做手术治疗。如果是小的巧克力囊肿，没有明显的痛经，也可以用药物治疗。如果有生育要求，要尽快的怀孕，因为子宫内膜异位症是引起不孕证比较重要的原因，所以随着病情的发展，不孕症的发病率会逐渐升高。卵巢巧克力囊肿做手术很容易复发，如果症状不是很严重，暂时可以保守治疗。
巧克力囊肿术后饮食，没有什么明显的饮食禁忌，对于新鲜的水果、蔬菜、鱼、虾、瘦肉、鸡蛋、牛奶均可以食用。但是对于比较特殊的食物，比如豆制品、豆浆、蜂王浆，尽量减少食用或者是不食用。
做完巧克力囊肿手术后要注意：首先是按照医生说的按时吃用药物，定期复查肝功能，生活上要注意好好休息一个月，一个月内不能性生活，不能盆浴，不能游泳。不要吃冷冻的食物，不要抽烟喝酒，饮食生活规律，多吃蔬菜水果，适当的吃鱼肉蛋，不要吃用刺激性的食品，少喝咖啡和浓茶等饮料。
手术后2个月内复查。如果你想检查卵巢囊肿，通常在月经干净后通过b超检查。与上一个结果相比，是否有渐进增长。如果典型的卵巢子宫内膜异位症囊肿可以通过病史、妇科检查结合B超诊断，但这不是金标准。其实有些卵巢子宫内膜异位囊肿的诊断比较困难，甚至需要腹腔镜诊断。
要注意劳逸结合，不要过度劳累，避免高度紧张及精神刺激，保持乐观开朗的心情，和平和的心态，增强机体的免疫力，平时注意保暖避免感冒受寒。加强体育锻炼，增强体质，多在阳光下运动，多出汗可将体内酸性物质。有辅助恢复的作用。
巧克力囊肿手术以后应该吃些营养的，温通经络的，滋补肝肾的食品，如山药，黑大豆，黑芝麻，核桃，黑米，豆制品，枸杞子炒菜煲汤，黑木耳，海带等，多补充维生素，补充蛋白质等。不吃或少吃辛辣剌激的，忌饮酒，忌喝碳酸饮料等，并注意加强体育锻炼，注意保暖，避免受寒受风受湿等。
